東晉僧人多，這就造成了社會(huì)矛盾。林子大了，什么鳥(niǎo)都有。很多人為了逃役而落發(fā)，也有把寺廟當(dāng)做避風(fēng)港，犯了罪逃去的。還有少數(shù)不法僧人破戒，破壞出家人形象的。不一而足。

桓玄下山后，就在考慮佛教泛濫的問(wèn)題。他是從政的，從政治角度考慮，要沙汰僧人。另外也是想樹(shù)威，為自己登臺(tái)做準(zhǔn)備。

這也是自佛教傳來(lái)后，中國(guó)捏著權(quán)柄的人首次提出整頓沙汰僧人，所以影響大。

他和僚屬們討論說(shuō)：一縣有數(shù)千人出家，這樣下去，既阻礙了社會(huì)發(fā)展，污染了民風(fēng)民俗，又?jǐn)牧朔鸾绦蜗蟆Ｋ岢隽松程抽T(mén)的原則和辦法：能說(shuō)經(jīng)者、經(jīng)常修習(xí)練功者、不和流俗一道者，這些人不在沙汰之列。但是“唯廬山道德所居，不在搜簡(jiǎn)之例”?；感?duì)慧遠(yuǎn)還是尊重的。

消息傳到山上，慧遠(yuǎn)神態(tài)嚴(yán)肅了。雖說(shuō)廬山不在搜簡(jiǎn)范圍，但他生怕當(dāng)權(quán)者以沙汰為借口，打擊沙門(mén)。再說(shuō)佛教界的問(wèn)題確實(shí)也嚴(yán)重，佛門(mén)的墮落也對(duì)佛教發(fā)展不利。他修書(shū)給桓玄，提出自己的看法，對(duì)不該沙汰的又增加了幾項(xiàng)。比如修建寺塔、造佛像、供奉舍利者等。據(jù)說(shuō)這次整頓，慧遠(yuǎn)保護(hù)了不少僧人。其實(shí)這樣做，對(duì)佛教界也有好處。有些平日不好下手的，也可以借政界下手。

慧遠(yuǎn)讓人將信送出后，立馬著手對(duì)廬山內(nèi)部的僧尼進(jìn)行整頓，擬定了若干節(jié)度僧尼的規(guī)定，并為之作序推行，如：《法社節(jié)度序》、《外寺僧節(jié)度序》等。

這天，弟弟慧持來(lái)告辭，說(shuō)要到成都一帶傳揚(yáng)教化，峨眉山水好，也好弘教?；圻h(yuǎn)有些不舍，慧持也很悲傷，但還是堅(jiān)持要走。

后來(lái)慧持到了成都，和當(dāng)?shù)卮淌方缓?。有一年，蜀郡?nèi)亂，慧持避亂到鄲縣。有個(gè)叫道福的，很兇殘，帶兵來(lái)到鄲縣，到處殺人。道福來(lái)到寺中，眾僧人很害怕，紛紛逃跑了。慧持在房中盥洗，神色安詳。道福來(lái)到慧持身邊，慧持彈指灑水，淡然自若，道福愧悔而汗流滿面，灰溜溜地走了。出了寺門(mén)之后，道福對(duì)手下人說(shuō)：“道德高尚的人就是與眾人不—樣。”公元412年，慧持卒于成都龍淵寺中，終年76歲。消息傳到廬山，慧遠(yuǎn)自是悲痛不已。