讓北大學生氣憤的是，這樣一位師長，竟被高層彈壓，被迫辭職離京。北大學生上書，要求下令挽留。馬寅初、李大釗、哲學系教授馬敘倫，一同去教育部請愿。如果教育部不全力挽留蔡校長，北大教師“將一致辭職”。教育部順應(yīng)民意，明文挽留蔡元培。蔡元培復電民國政府，強調(diào)對學生不可以鎮(zhèn)壓，否則絕不返校。

學潮本已平息，鄧中夏和地質(zhì)系學生高君宇，又組建起“北京市中等以上學校學生聯(lián)合會”，號召抵制日貨，把學潮推向新高。5月17日，外省學生上街游行，聲援北京。19日，北京25000名學生再次總罷課，四處演講，抵制日貨，還組織起“護魯義勇隊”。

學潮在全國迅速蔓延，許德珩率同學南下天津、濟南、南京、上海。5月21日，各地學聯(lián)代表在上海龍華體育場開群眾大會，北大代表說，“孫中山先生的革命，僅僅把大清門的牌匾換作中華門，這樣的革命不算徹底，我們這次，要做徹底的革命”。恰好，孫文從廣東負氣出走，剛剛抵達上海，他告訴北大學生，“我所領(lǐng)導的革命，倘早有你們這樣的同志參加，定能成功”。

6月3日，北大有大批學生走上街頭，進行演講。反動當局出動了軍警進行大逮捕，第一天就有178人被捕，其中十之七八，是北大學生。第二天有更多的學生走向街頭進行講演，向群眾做宣傳。這一天，北洋政府出動了馬隊，對學生隊伍進行沖擊，有七八百學生又被逮捕。但是北大學生斗爭也很英勇。第三天，又有更多的學生走向街頭。

——北大原副校長沙建孫

6月11日，已被北大拋棄的陳獨秀，來到前門外，跑上新世界游藝場3層，散發(fā)《北京市民宣言》。當晚，警察突然闖進北池子箭桿胡同9號，抄了陳獨秀的家，逮捕了陳獨秀。長沙學運領(lǐng)袖毛澤東在《湘江評論》上發(fā)表《陳獨秀被捕及營救》，說陳獨秀被捕，“無非是為著賽因斯和德莫克拉西”，他盛贊陳獨秀是“思想界明星”，具有“至高至賢精神”。

全國引起了很大的震動，首先是上海的六七萬工人自動投入斗爭，全國有20多個城市，工人罷工，商人罷市，學生罷課，這樣就形成了一個廣大的群眾運動的聲勢。

——北大原副校長沙建孫

6月10日，徐世昌總統(tǒng)在曹汝霖、章宗祥、陸宗輿毫不知情的情況下，“批準”他們辭職。23日，徐世昌會見各界代表，山東代表聲淚俱下，說“自濟南啟程時，山東父老兄弟姐妹皆環(huán)跪車站，叮囑代表請求不遂，不得生還”。后來做了全國政協(xié)副主席的屈武，當時是陜西請愿學生代表。他曾慷慨陳詞，說到痛心處，跪地痛哭，以頭觸地，鮮血直流。徐世昌當即宣布，他已電令巴黎，從緩簽約。

1919年6月28日，陸徵祥拒絕在《凡爾賽對德和約》上簽字，山東權(quán)益案暫時懸留。

老北大的校慶日，是12月17日，1953年以后，才改成5月4日，這無非是因為北大發(fā)起了五四學潮。把一座著名學校的生日，改成另一個日子，不一定合理，但它至少可以說明，五四學潮對北大的重要性。換句話說，沒有五四學潮，北大的社會影響不會那么大。