由于毛主席的這一“反骨”結(jié)論，黃萬(wàn)里在“右派”前又加了一個(gè)“大”字，成了罪大惡極的“大右派”，帽子一戴就是22年半， 直到1980年2月26日，才獲得了“右派改正的決定”，成為清華大學(xué)最后一個(gè)摘帽的右派分子。

1957年4月13日，黃河三門峽水利樞紐工程正式開(kāi)工。張光斗因?yàn)橘澇尚迚纬闪巳T峽工程的中方技術(shù)負(fù)責(zé)人。一時(shí)間，河南與陜西兩省熱鬧起來(lái)。同月，西安農(nóng)業(yè)展覽館緊跟形勢(shì)，舉辦了“三門峽工程圖片資料展”。在門口最顯赫位置的一塊模板上，書有“圣人出，黃河清”六個(gè)金光閃閃的大字。其時(shí)簡(jiǎn)化字剛推行不久，許多人不認(rèn)識(shí)被簡(jiǎn)化了的“圣”字（正體為“聖”），圍觀者交頭接耳小聲議論，忽見(jiàn)當(dāng)?shù)厝怂屯馓?hào)“二桿子”的中年漢子高聲朗讀曰：“怪人出，黃河清?！痹捯魟偮?，“二桿子”就被現(xiàn)場(chǎng)的保衛(wèi)人員三拳兩腳掀翻在地，五花大綁押入公安機(jī)關(guān)，爾后以現(xiàn)行反革命分子罪名打入深牢關(guān)了起來(lái)。鑒于這一“怪人出”的政治事件，展覽館的領(lǐng)導(dǎo)者怕惹火燒身，很快就取掉了上寫六個(gè)大字的模版。

模板是取掉了，但那位不知名的“二桿子”高聲呼喊的話，像是一句讖語(yǔ)，昭示著未來(lái)的不祥之兆。不但黃河沒(méi)有變清，反倒是滾滾泥沙淤死了三門峽大壩，回水倒灌涇渭河，淹了富庶的八百里秦川。千古民族宿愿，又一次在混沌的黃水里化為泡影。

1961年，三門峽大壩建成，1962年2月第一臺(tái)15萬(wàn)千瓦機(jī)組試運(yùn)轉(zhuǎn)，總投資9.42億元人民幣，對(duì)當(dāng)時(shí)的新中國(guó)來(lái)說(shuō)，可以說(shuō)是傾全國(guó)之力。建成后的工程雖然給黃河下游防洪安瀾和灌溉、發(fā)電等方面帶來(lái)了一定經(jīng)濟(jì)效益，但在建造時(shí)由于沒(méi)有考慮排沙這一關(guān)鍵性技術(shù)問(wèn)題，泥沙淤積問(wèn)題日益突顯。據(jù)國(guó)家水電部資料顯示，1960年工程蓄水，到1962年2月發(fā)電時(shí)，水庫(kù)就淤積了15億噸泥沙；到1964年11月，總計(jì)淤積泥沙50億噸。越三年，庫(kù)內(nèi)淤塞泥沙達(dá)34億立方米，幾為設(shè)計(jì)庫(kù)容的一半。而黃河回水，使潼關(guān)河床淤高了4.5米，迫使黃河最大支流——渭河水位上升，直接威脅中國(guó)西北的經(jīng)濟(jì)中心西安的安全。中國(guó)最富裕的關(guān)中平原，大片土地出現(xiàn)鹽堿化和沼澤化，使得庫(kù)區(qū)移民上上下下來(lái)回反復(fù)遷徙，十幾萬(wàn)人弄得家貧如洗，疾病纏身，男女老少啼饑號(hào)寒，其凄苦悲慘之狀，令見(jiàn)者為之淚下，曾代表國(guó)務(wù)院前往考察的高官大員面對(duì)慘象，亦禁不住說(shuō)：“國(guó)家對(duì)不起你們”。據(jù)黃萬(wàn)里的長(zhǎng)公子黃觀鴻說(shuō)：當(dāng)時(shí)三門峽的敗象日顯，陜西泥沙日積，地方官忍無(wú)可忍，繞過(guò)周恩來(lái)徑向毛澤東告狀，毛澤東急了，說(shuō)：“三門峽（大壩）不行就把它炸掉！”

為情勢(shì)所迫，1964年，三門峽不得不進(jìn)行第一次改建，強(qiáng)行用炸藥在壩底炸開(kāi)了“兩洞四管”，以用于泄流排沙；1969年，又進(jìn)行了第二次改建，耗資八千萬(wàn)元，再度在壩底炸開(kāi)了8個(gè)孔洞，進(jìn)一步增大了泄流排沙的能力。盡管如此，依然留有巨大隱患。2003年8月，渭河一場(chǎng)洪災(zāi)，使建成40多年的三門峽水利樞紐工程再次成為社會(huì)各界爭(zhēng)論的焦點(diǎn)。據(jù)陜西方面的水利專家說(shuō)：“今年渭河的水并不大，只相當(dāng)于渭河5年一遇的洪水。但今年形成的災(zāi)害比較大，相當(dāng)于渭河50年一遇洪水的災(zāi)害（其中華縣、華陰市遭受了自1556年以來(lái)500年最大的災(zāi)害，生活水平倒退了10年），這場(chǎng)災(zāi)害使陜西全省有1080萬(wàn)畝農(nóng)作物受災(zāi)，225萬(wàn)畝絕收，成災(zāi)人口515萬(wàn)人，直接經(jīng)濟(jì)損失達(dá)82.9億元?！保▍⒁?jiàn)2004年02月22日《工人日?qǐng)?bào)》）當(dāng)年黃萬(wàn)里“黃河下游的洪水他年必將在上游出現(xiàn)”的預(yù)言再一次不幸言中。

據(jù)陜西省水利志的記載和近現(xiàn)代水利專家的考察，渭河在歷史上并不是一條淤積嚴(yán)重的河流，從春秋戰(zhàn)國(guó)時(shí)期到1960年的2500年間，河床淤積厚度僅為16米，平均每100年才淤積0.6米。自三門峽水庫(kù)建成后淤積速度可謂一泄千里。據(jù)2003年10月22日潼關(guān)水文站所測(cè)數(shù)據(jù)，當(dāng)天的潼關(guān)高程是327.94米，而1960年只有323.40米，僅僅40多年時(shí)間竟比過(guò)去高出了4.5米，相當(dāng)于歷史上750年淤積量。因潼關(guān)高程居高不下，關(guān)中水患則永無(wú)窮盡。