雙方爭論的焦點(diǎn)最終還是要?dú)w結(jié)到“‘問題’和‘主義’是如何產(chǎn)生的？”這一發(fā)生學(xué)的問題上。在這個(gè)問題上，經(jīng)驗(yàn)主義的主張與理性主義的思想有著根本的差別。藍(lán)公武受歐洲大陸理性主義思想方法的影響很大。在“‘問題’和‘主義’是如何產(chǎn)生”的“問題”上，其思維方式是典型的理性主義的。他認(rèn)為，“問題初起之時(shí)，一定先為抽象性，后才變成具體性的”；“世間有許多極有力量的主義，在他發(fā)生的時(shí)候，即為一種理想，并不是什么具體方法，信仰這主義的，也只是信仰他的理想，并不考究他的實(shí)行方法”。并說問題初起的抽象性最合于人類的一種神秘性。實(shí)驗(yàn)主義是經(jīng)驗(yàn)主義的一種表現(xiàn)形式。作為實(shí)驗(yàn)主義的信徒，胡適認(rèn)為，凡是能成問題的問題，無論范圍大小，都是具體的，決不是抽象的。問題本身，并沒有什么抽象性。只是在研究問題的時(shí)候，往往必須經(jīng)過一番理想的作用，而這一層理想的作用，不可錯(cuò)認(rèn)作問題本身的抽象性。同時(shí)，胡適還批評(píng)了藍(lán)公武所謂的人類的神秘性。胡適指出，人的這種“神秘性”“只是人類的愚昧性”，“實(shí)在是人類的一點(diǎn)大缺陷”。并且，“人類受這種劣根性的遺毒，也盡夠了。我們做學(xué)者事業(yè)的，做輿論家的生活的，正應(yīng)該可憐人類的弱點(diǎn)，打破他們對(duì)于抽象名詞的迷信，使他們以后不容易受這種抽象的名詞的欺騙”。而解決之道，只有“多研究些具體的問題，少談些抽象的主義”。

所以，雙方思想方法的差異是根本性質(zhì)的差異。經(jīng)驗(yàn)主義認(rèn)為，任何的經(jīng)驗(yàn)都來源于具體的問題——發(fā)現(xiàn)問題，分析問題，解決問題。同時(shí)，對(duì)于任何現(xiàn)實(shí)問題的解決也只有靠過去既有的經(jīng)驗(yàn)。所以，在連結(jié)過去、現(xiàn)在和未來的一切關(guān)系上，只有以“經(jīng)驗(yàn)”作為連結(jié)“經(jīng)驗(yàn)”的方式，此外沒有任何有效的“連結(jié)”。在《徹底的經(jīng)驗(yàn)主義》一文中，威廉·詹姆士指出經(jīng)驗(yàn)主義在這方面所持的基本觀點(diǎn)。他說：“一種經(jīng)驗(yàn)主義，為了要徹底，就必須既不要把任何不是直接所經(jīng)驗(yàn)的元素接受到它的各結(jié)構(gòu)里去，也不要把任何所直接經(jīng)驗(yàn)的元素從它的各結(jié)構(gòu)里排除出去。對(duì)于像這樣的一種哲學(xué)來說，連結(jié)各經(jīng)驗(yàn)的關(guān)系本身也必須是所經(jīng)驗(yàn)的關(guān)系，而任何種類的所經(jīng)驗(yàn)的關(guān)系都必須被算做是‘實(shí)在的’和該體系里的其他任何東西一樣。元素固然可以因?yàn)槭挛镌瓉淼陌才鸥恼硕恢匦路峙?，但是，在最后的哲學(xué)安排中，必須給每一種類的所經(jīng)驗(yàn)的事物（無論是關(guān)系項(xiàng)或是關(guān)系）找到一個(gè)實(shí)在的位置。連接性的關(guān)系和分離性的關(guān)系都表現(xiàn)為經(jīng)驗(yàn)之完全對(duì)等的部分。”