當(dāng)大家都認(rèn)為王云五事業(yè)風(fēng)生水起、人生得意的時候，他卻有了新想法。1929年9月，王云五辭去商務(wù)印書館編譯所所長一職，擔(dān)任國民政府中央研究院研究員兼法制組主任。

王云五離開商務(wù)主要有兩個原因。人們說婚姻有“七年之癢”，其實(shí)職業(yè)發(fā)展也是一樣。從王云五正式擔(dān)任商務(wù)的編譯所所長算起，到1929年的時候，正好七年了，這在他已經(jīng)是最長的履歷，但王云五尚未看到升遷的希望，于是決意離去，這是一個原因。另一個原因還在于他的為人。

王云五的功利思想嚴(yán)重，只要是他在商務(wù)印書館編撰的圖書，都要抽取版稅，而按照規(guī)定，內(nèi)部工作人員編書是不付稿酬或版稅的。王云五不僅拿錢，還最愛署“王云五主編”，這在知識分子成堆的地方，自然會引來諸多議論。偏偏王云五非常看重名聲，雖然他認(rèn)為自己編書拿錢天經(jīng)地義，卻架不住被眾人詬病。正在此時，南京國民政府中央研究院剛剛成立，主持工作的傅斯年四處網(wǎng)羅人才，王云五看這個機(jī)會也不錯，便決意離開商務(wù)前往南京，去了半年時間，他就出版了一本著作《中國古代教育思潮》。

只是研究員也就做了半年，戲劇性的一幕拉開了。

1930年2月，商務(wù)印書館總經(jīng)理鮑咸昌突然去世，張元濟(jì)此時已是六旬老人，無意就任總經(jīng)理，一時間竟然找不到合適的人選，董事會經(jīng)過討論，最后決定請王云五回來做總經(jīng)理。這里應(yīng)該說說張元濟(jì)的用人之道。王云五在商務(wù)印書館的時候，張元濟(jì)一直力挺他，王愛署名、愛抽版稅的做法張元濟(jì)是看在眼里的，他對此也很有意見，但是作為一個寬厚仁慈的長者，張元濟(jì)同時看到了王云五的才干，王進(jìn)入商務(wù)幾年做事的魄力和成效確非一般員工所能及。

總經(jīng)理的職務(wù)雖然誘人，但是精明的王云五非常明白，這個時候接這個崗位可沒那么好干。首先商務(wù)印書館的人事關(guān)系復(fù)雜，工作10年以上的老人眾多；其次商務(wù)印書館工潮不斷，工會力量強(qiáng)大，王云五做編譯所所長的時候就經(jīng)常出面處理各種糾紛。所以他明白，無論是商務(wù)的上層還是底層，都有一堆麻煩事，不好應(yīng)付?？墒菑堅獫?jì)、高夢旦等人又一再邀請，王云五思前想后，決定接下這個職務(wù)。

不過他提了兩個條件。一是取消此前的總務(wù)處合議制，改由總經(jīng)理獨(dú)任制；二是接任后馬上出國考察并研究科學(xué)管理，為期半年。

王云五非常清楚，與前幾任總經(jīng)理相比，他的資歷和聲望都難以望其項背，如果沿用合議制，他的很多想法就無法推行，獨(dú)任制說白了就是總經(jīng)理說了算；至于出國考察，則是希望看看國外是怎么進(jìn)行現(xiàn)代企業(yè)管理、提高工作效率的，當(dāng)然還有一點(diǎn)，是了解國外怎樣解決勞資糾紛。

商務(wù)印書館作為一家采用資本主義方式進(jìn)行管理的企業(yè)，實(shí)事求是地講，在員工福利方面采取了不少措施，比如花紅制度、退俸金制度等，考慮比較周全。職工收入在上海的文化企業(yè)中算偏高的，但是在當(dāng)時工人運(yùn)動迭起的時代浪潮里，商務(wù)的勞資糾紛經(jīng)常發(fā)生，工人罷工也此起彼伏，這就讓商務(wù)的領(lǐng)導(dǎo)人備受困擾。張元濟(jì)一介書生，不擅處理這些事，一般力求和平解決，不愿擴(kuò)大矛盾。王云五因?yàn)榧雀删氂謭A通，所以在編譯所所長任上經(jīng)常被抬出來面對勞資糾紛，雖然每次都能獲得暫時解決，但老是如此，自然令他身心疲憊。于是，看看國外怎么處理這種問題，也是他迫切的需求。

的確，沒有這兩個條件，要管理商務(wù)印書館這樣的機(jī)構(gòu)如同一句空話。王云五的精明在此可見一斑。董事會答應(yīng)了他的這兩個條件，1930年3月初，王云五被任命為新任總經(jīng)理。