震旦大學借地于耶穌會在徐家匯的天文臺內(nèi)，師資也由教會支援?！罢鸬笔侵袊墓欧Q，來自梵文，中文字面上又有“日出東方”的含義，借這個生機勃勃的名字，馬相伯此時此刻找到了自己的使命。馬相伯所設計的震旦不是英美式學院（College），而是歐洲文藝復興以來研究學問的學者團體、學院（Academy），或者是更古典式的柏拉圖式“學園”（Academy），提倡學生在辯論中發(fā)展獨立思考能力和表達能力。馬相伯所理解的歐洲Academy與中國傳統(tǒng)書院有某種相似性。在震旦，教，注重指導門徑；學，力求啟發(fā)學生獨立研究問題的能力。所以，馬相伯本人在震旦的角色可謂“柏拉圖”，亦可謂書院的“山長”。

震旦的行政管理由學生選出代表承擔，學校的所有成員享有自治、自主的權利。當時幫助馬相伯辦學的學生邵力子、于右任等，均成為中國近代史中可圈可點的人物。

震旦學院宣布成立，當時流亡日本的梁啟超立即著文稱善：“吾今乃始見我國得一完備有條理之私立學院，吾喜欲狂。”馬相伯為學校規(guī)定三條原則：崇尚科學，注重文藝，不談教理。“欲革命救國，必自研究近代科學始；欲研究近代科學，必自通其語言文學始。有欲通其外國語言文學，以研究近代科學，而為革命救國之準備，請歸我。”

馬相伯有很多的創(chuàng)造，比如他主張文理并重，主張要打好語言的基礎，主張必須訓練嚴格的邏輯思維?，F(xiàn)在中國最早的形式邏輯的教科書是馬相伯編的。我們今天說，中國學生原創(chuàng)力不夠，其實這個問題馬相伯當時就已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了，他所設計的課程、教育方法，都有助于提高學生的原創(chuàng)力。還有一條，他認為教育要自立，希望學術獨立，思想自由。

在震旦學院，馬相伯是非常愛護學生的，他重建了孔子以來“有教無類”的傳統(tǒng)，只要有才華的人、愿意學的人，他一律收入門下。于右任就是非常典型的例子。1904年，于右任因作詩諷刺慈禧太后賣國，遭到通緝，逃到了上海。馬相伯將他收入門下，免學雜費，以化名“劉學?！保础傲魍鰧W生于”諧音）入讀震旦，并對他諄諄教誨：不以空言抒憤，救國必先科學。后來于右任曾有聯(lián)：生我者父母，育我者先生。

學術獨立，不談教理

“不談教理”的辦學理念，使馬相伯和作為主辦方的耶穌會有著不可調(diào)和的矛盾。耶穌會希望震旦是法國式的教會學校，學生要遵從教規(guī)。這和馬相伯的辦學初衷相違背，他為震旦制定的辦學原則是：崇尚科學、注重文藝、不談教理。法國傳教士認為學生既然到了教會的學校，就應該把宗教課變成必修課，這等于強迫信仰，這是馬相伯最反對的。

1905年年初，沖突演變的結果是耶穌會出手驅逐馬相伯，讓他“無病而入病院”，欲奪回震旦的控制權。但神甫們忘記了，震旦的首批學生，部分來自堪稱學生運動策源地的南洋公學，豈是唯唯諾諾之輩。在校務行政上，震旦是實行學生自治制度的，學生遂推舉沈步洲為會議主席，決議退學。沈步洲取出信箋兩卷，放在講臺兩端，一為簽留，一為簽去，結果全校132名學生中有130名簽名退學。

退學學生推舉邵力子、于右任等7名學生代表，事后找到馬相伯，說：“馬院長，我們已經(jīng)退學了，但是我們還要讀書?！瘪R相伯看到退學學生簽名簿時老淚縱橫，他冒著再次和教會決裂的風險，決定站在學生一邊，另辦新校。

1905年9月，經(jīng)過馬相伯、嚴復和退學學生領袖葉仲裕、于右任等人數(shù)月的奔波籌劃，復旦公學在吳淞成立?！皬偷币辉~，取自《尚書大傳》中虞舜傳位給夏禹時所唱的青云歌“日月光華，旦復旦兮”，可以釋義為“明天太陽照常升起”，既寓意新學校像朝陽一樣，也有光復震旦的意思。