與此同時，普京重新打造克格勃系統(tǒng)。2003年3月，大力加強俄聯(lián)邦安全局的機構設置，使之成為僅次于國防部的強力部門，成為當年克格勃的縮版。2005年，普京下令斥資數(shù)百萬英鎊，拍攝俄版“007”，為克格勃平反。 

普京還重用了一批有克格勃背景的人。這種嗜好讓普京時代的俄羅斯政壇出現(xiàn)了一批新克格勃權貴。2001年3月政府改組，普京一口氣更換了四大強力部門的負責人，讓同鄉(xiāng)、同學和克格勃同事伊萬諾夫出任國防部長，讓團結黨議員團領導人格雷茲洛夫出任內務部長，分別控制了軍隊、警察和內務部隊。同時，剛建立的七大聯(lián)邦區(qū)的總統(tǒng)全權代表，也大都出身于克格勃，是普京的知己和親信。據(jù)俄羅斯社會學家統(tǒng)計，在普京第一個總統(tǒng)任期結束時，身居要職的官員中“戴過肩章的人”比例已達50%。而正是這些來自原克格勃系統(tǒng)和其他強力部門的干部，在幫助普京實行“鐵腕治國”方面起了重大作用。