第三，南渡以后，王導(dǎo)、王敦等人對于江南的穩(wěn)定起到了至關(guān)重要的作用。為了提高司馬睿的聲望，王導(dǎo)讓曾為青州刺史的王敦騎馬跟在司馬睿轎子后面游行；為了拉攏江南人士，王導(dǎo)主動與陸玩結(jié)親，學(xué)習(xí)吳地方言；為了減少僑民與南方大族之間的矛盾，也為了維護門閥士族的利益，王導(dǎo)盡量采取“清凈無為”的執(zhí)政理念，對于大族子弟的一些違法亂紀行為忍之又忍。王敦則主管軍事，在討伐叛亂中居功至偉?？梢哉f，兄弟二人為司馬睿在揚州地區(qū)站穩(wěn)腳跟，繼而為司馬睿擴大統(tǒng)治區(qū)域，起到了很大作用。

過江伊始，司馬睿并沒有牢牢地把握住政權(quán)。那時，王導(dǎo)“政皆決之，號仲父”參見《世說新語·言語》“顧司空未知名”條注引鄧粲《晉紀》。。司馬睿剛過江的時候，他母親就去世了。司馬睿為此還離開了江南兩三個月，專門回瑯邪國去辦喪事，這件事也從側(cè)面說明：在當時承擔協(xié)調(diào)各方、穩(wěn)定時局重任不可須離的人，不是司馬睿，而是王導(dǎo)。

先天不足的司馬睿，在王導(dǎo)、王敦的一手扶植下總算站穩(wěn)了腳跟。正如《晉書·王導(dǎo)傳》上所說的那樣：“吳會風靡，百姓歸心焉。自此之后，漸相崇奉，君臣之禮始定?！比欢?，當司馬睿的地位逐漸穩(wěn)定以后，他與王氏家族的矛盾也開始凸顯了出來。

究其原因，當然是權(quán)力之爭，但也與雙方的執(zhí)政理念有所差異有關(guān)。據(jù)《資治通鑒》記載，王導(dǎo)為司馬睿制定的國策是“謙以接士，儉以足用，以清靜為政，撫綏新舊”。王導(dǎo)的“清凈為政”，表現(xiàn)在諸多方面：對門閥特權(quán)的保護；對高門大族(包括江南豪族)違法行為的容忍；延續(xù)高門大族原有的名士生活方式等等。

在王導(dǎo)這一指導(dǎo)思想下，司馬睿安撫住了江東大族，平衡了南渡僑民，也維護了南來的王氏家族的利益。但是，這一政策的負面影響不可小視。它主要表現(xiàn)在當時江東的社會治安非常不好。此類記載隨處可見?！妒勒f新語·任誕》記載：祖逖(音tì)在江南之時，就公然率領(lǐng)部眾搶劫富戶，并當著王導(dǎo)、庾亮等王公大臣的面，毫不掩飾自己的所作所為，而王導(dǎo)等“在事之人亦容而不問”?！稌x書·賀循傳》記載：廷尉張闿胡作非為也沒有人去管。群眾只好找到江南的大族賀循，而賀循只說了一句，等我見到張廷尉了會說到這個事。

無意抹殺王導(dǎo)這種政策的積極意義，但是客觀地講，亂世中所謂的“清凈為政”，一方面僅僅著眼于維護江東半壁江山的割據(jù)狀態(tài)，而另一方面骨子里還是為了維護王氏集團在江南的既得利益。

作為一位想大權(quán)獨攬的君主，司馬睿當然對這種情況不能坐視不理。于是，司馬睿起用了大量非王氏家族的大臣，開始逐漸疏遠王導(dǎo)。司馬睿主要采取了幾項措施。

一是把高官授予江東以外的名臣。相應(yīng)的，王氏的人就無法染指這些職位了。如在建武元年七月，司馬睿任命身在許昌的太尉荀組為司徒，十二月又任命司空劉琨為太尉等。