在處理不當便會決裂的情況下，清廷不敢怠慢，他們拋開需要三天才能處理的通常程序，而是以特事特辦的最快速度來了結此事。在經(jīng)過一番緊急的磋商和請示后，5月31日的清晨2點，總理衙門通知英國公使竇納樂，告訴他們外國公使館的警衛(wèi)隊可以進駐北京。這個通知時間搶在公使們限定的時間前，暫且避免了外交甚至是軍事上的決裂，也保全了清廷那點可憐的體面。清廷之所以批準了使館衛(wèi)隊入京，原因不外乎兩條，一是1898年有使館衛(wèi)隊入京的先例；二是使館衛(wèi)隊的人數(shù)有限，應該不會造成很大的麻煩。因此，總理衙門要求各國衛(wèi)隊的人數(shù)不得超過30人，這也是1898年的先例。

可惜的是，洋人并沒有把清廷的人數(shù)限制放在眼里。就在5月31日的當天傍晚，第一批使館衛(wèi)隊從天津登上火車前往北京。據(jù)美國公使康格的夫人記載，這次美國方面來了56名海軍士兵，他們帶著一挺速射機槍；英國士兵75人；法國士兵75人；日本士兵40人；俄國士兵75人；意大利士兵40人，共計361人。從火車站到公使館，警衛(wèi)隊沒有遭遇到任何不快的事情。

關于使館衛(wèi)隊的人數(shù)問題，各方記載不一，《西巡回鑾始末記》中記載：“英水師兵八十人，俄法水師兵各七十五人，美水師兵五十人，意兵三十人，日水師兵三十人。到時，所過街市，觀者為滿?；枰归g，華人不能知其實數(shù)，遂以為西兵大至。六月三號，本日午車又運來德水師兵五十名，奧水師兵三十五人”。這樣算來，第一批衛(wèi)隊是340人，而據(jù)意大利公使薩瓦戈記載，第一批使館衛(wèi)隊為337人；至于德國和奧地利的士兵，他們在在6月2日才到達北京，但這個數(shù)字也都記載不同，譬如薩瓦戈記載是德國52人、奧地利37人。綜合下來，衛(wèi)隊的人數(shù)應該在450人左右。當然，我們沒有必要在數(shù)字上過多糾纏而只需確認一個事實，那就是洋人的衛(wèi)隊已經(jīng)進入了北京并開始執(zhí)行保護使館的任務。

各國衛(wèi)隊的進駐讓外交官們暫時感到了安全，但北京周圍的局勢卻并沒有好轉的跡象。就在使館衛(wèi)隊到達北京的當天（6月1日），兩名英國傳教士在北京以南的永清縣被義和拳所殺。由于北京到保定的鐵路遭到義和拳的焚毀，當時承擔盧漢鐵路建設的比利時工程師一行人在恐慌之中逃亡天津，在途中遭到了義和拳的攻擊，其中有兩人被殺，而這也是義和拳第一次殺害傳教士之外的外國人。

由于比利時在中國沒有軍隊，于是他們請求俄國公使代為提供幫助。隨后，俄國公使格爾思派出了一小隊哥薩克騎兵前往搜索援救比利時人，但在途中與義和拳發(fā)生沖突，其中的一名軍官被殺，另一名士兵被割了鼻子。此事發(fā)生后，英法公使們既感到震驚，又不免有些幸災樂禍。英國公使竇納樂認為，“歐洲軍人在拳民面前不得不退卻這一事實將引起極壞的影響，因為它將使中國百姓更加相信義和團的所謂神力”；而德國公使克林德在同意這個觀點的同時，卻暗中譏諷哥薩克騎兵過于輕敵：“他們一天勞累后，狂飲伏特加，然后在一個農(nóng)民家中呼呼大睡，連崗哨都沒有設”。

壞消息接踵而至。公使們通過各種渠道了解到清廷對義和拳的態(tài)度似乎在發(fā)生轉變。在6月6日的上諭中，清廷雖然對義和拳破壞鐵路和社會秩序等行為嚴加斥責并恫言剿殺，但在上諭的開始卻聲稱“民教”失和的原因在于傳教士干涉詞訟。公使們通過各種渠道了解到，清廷對于北京外圍的義和拳似乎打算采取招撫政策，這大概是從趙舒翹、何乃瑩出城前往涿州一事所推測出的，而這似乎又證明了那些仇外守舊派在清廷中的日益占據(jù)上風。

據(jù)康格夫人的記載，從6月7日開始便不斷有傳教士來到使館并要求康格派衛(wèi)隊去保衛(wèi)他們，但康格認為將士兵化整為零將是一個極不明智的做法，于是他提出了讓傳教士全部集中到公使館中來的建議。隨后，通州等地的傳教士帶著他們的教民陸續(xù)來到北京使館或教堂避難，各使館也開始為緊急情況而儲備淡水和食品，在此情況下，公使夫人們（英、美）都急于將自己的孩子送到日本（后因局勢混亂而未果）。