1946年4月，黃鼎臣根據中共華南分局的指示，應陳其尤邀請亦到達香港，并出席了致公黨中央干事會會議。黃鼎臣指出：“在中國歷史的轉折關頭，中國致公黨面臨著向何處去的問題，在革命與反革命的生死搏斗中，中間黨派沒有中立的余地。”因此，建議致公黨參加中國共產黨領導的新民主主義革命。對此，陳其尤深表贊同，并親自介紹黃鼎臣加入致公黨，參加致公黨的改組工作。

經過長時間的籌備工作，中國致公黨第三次代表大會于1947年4月29日至5月1日在香港召開。會議決定加入中國共產黨領導的人民民主統(tǒng)一戰(zhàn)線，并選舉產生了新的領導機構，李濟深當選為中央主席（對外不公開），陳其尤為副主席，實際負責致公黨的領導工作。以此為標志，中國致公黨從一個舊式政黨轉變?yōu)橐粋€新型政黨，成為人民民主統(tǒng)一戰(zhàn)線的重要一員。

致公黨“三大”后，陳其尤作為民主運動中的一名勇猛斗士，積極投入到反蔣斗爭的洪流之中，為推翻國民黨蔣介石的反動統(tǒng)治，配合人民解放戰(zhàn)爭的勝利發(fā)展，做出了重要貢獻。

1947年8月19日，針對國民黨政府頒布《總動員法案》，陳其尤領導的致公黨發(fā)表《為反對國民黨政府“總動員法”告全體黨員書》，一針見血地指出：“總動員法”所含有的內容無一而不是害國害民的，它把和平之門永遠關閉，決心與人民為敵到底，這究竟是何居心？“國民黨政府前途之黯淡，亦于此可見了?！?/p>

1948年3月1日，為教育和幫助廣大致公黨黨員更好地認清形勢，表明自己的政治態(tài)度，陳其尤發(fā)表《認清現(xiàn)實，不要猶豫》一文，指出：“為了人民的利益，我們不畏懼南京獨裁政權任何污蔑，說我們偏袒中共也好，做中共的尾巴也好，一切都由他罷，事實總是事實?！薄盀榱酥袊嗣竦睦妫覀冎挥袕氐椎叵麥缒暇┑馁u國獨裁統(tǒng)治，沒有讓我們中立的空間，更不容我們有猶豫的時間。”