清朝廷授予鄭芝龍閩粵總督的官銜，鄭芝龍笑納了。一切看來很順利，當(dāng)年高官厚祿的情節(jié)似乎馬上又要重復(fù)上演一次。但是這一次鄭芝龍錯(cuò)了，錯(cuò)得很大。他從泉州來到福州后，很快就被押往北京，隨即軟禁起來。而他在泉州安平的老家，則迅速遭受洗劫。那時(shí)，他的妻子田川氏正在安平。1630年他只接回大兒子，直到1645年冬妻子田川氏才離開日本跟隨他身邊，但僅僅幾個(gè)月，鄭芝龍降清了，鄭芝龍被軟禁北上了，留下孤獨(dú)無援的她。清兵洪水般涌來，為免受羞辱，她剖腹自盡，時(shí)年40歲。

家仇國(guó)恨沉甸甸地?cái)D壓在鄭成功心頭，1646年這個(gè)多事之秋，22歲的鄭成功經(jīng)歷太多的驟然變故。他有兵權(quán)了，他掛起帥旗了，但王朝灰飛煙滅了，接著家破人亡又赫然展現(xiàn)。刀光血?jiǎng)ν鹑粢粓?chǎng)連天的大雨，一下子將他的生活完全淋透。

埋葬了母親田川氏之后，傳說鄭成功曾有一個(gè)焚燒儒服之舉。他來到泉州市郊一座孔廟里，先恭恭敬敬地磕拜先師，然后又將從前捧卷苦讀時(shí)所穿的青衣長(zhǎng)衫點(diǎn)一把火燒毀了。他不再是書生，不再文弱地躲進(jìn)書房與筆墨經(jīng)卷為伍。他要拉起隊(duì)伍，從此走入血腥歲月，走上反清復(fù)明之路。

廈門島，那時(shí)還不過是一個(gè)荒涼的邊陲小城，而距廈門僅2300多米之遙，面積平方千米的小金門，成為鄭成功最初的立足之地。作為孤臣孽子，他已經(jīng)沒有退路。嚴(yán)酷的局勢(shì)已經(jīng)把他逼到人生的懸崖邊上，他只能以一己之力，在這個(gè)蒼茫的海天之間、這個(gè)小小的島嶼之上，開始了遙遠(yuǎn)而艱辛的跋涉之旅。如果這是一場(chǎng)賭博的話，他已經(jīng)把自己的未來一絲不留地全部抵押了進(jìn)去。廈門鼓浪嶼圖片

當(dāng)然，另一種說法是鄭成功起兵應(yīng)該在安平，而非小金門。無論如何，一面旗子在那個(gè)陰郁幽森的年代里好歹豎起來了——招討大將軍。這曾是那位已經(jīng)被清朝廷所殺的隆武皇帝朱聿鍵賞賜給他的一個(gè)封號(hào)，這時(shí)索性就在天地間張揚(yáng)起來吧。1656年，他甚至將廈門改為“思明州”，公開昭示懷念并欲恢復(fù)明朝之意。

漸漸有人往這面旗子下聚集了，沿海各地不愿歸順異族的百姓以及鄭芝龍殘留的余部，他們各自帶著忐忑不安與隱約的期許一撥撥投奔而來。武裝隊(duì)伍壯大得非?？欤⑶壹o(jì)律嚴(yán)明，訓(xùn)練有素，很快就在中國(guó)東南沿海土地上生長(zhǎng)拔節(jié)，成為令清王朝坐立不安的一根利刺。

無海即無家，這曾是鄭芝龍一貫的理念，現(xiàn)在輪到鄭成功將其繼承與發(fā)揚(yáng)了。

除了按明朝例，在廈門建立政機(jī)機(jī)構(gòu)，委任吏官、戶官、禮官、兵官、刑官、工官等官職外，鄭成功還在廈門、蘇杭等地設(shè)立商行，把內(nèi)地貨物集中到廈門上，然后販運(yùn)到日本。當(dāng)時(shí)設(shè)在臺(tái)灣的英國(guó)商館估計(jì)，臺(tái)灣每年平均有十四五艘大船赴日本貿(mào)易，另有五六艘大船赴馬尼拉貿(mào)易。經(jīng)濟(jì)的強(qiáng)盛，令他的兵馬迅速擴(kuò)大。鼎盛時(shí)期，他所擁有的水陸精兵達(dá)到了20多萬，戰(zhàn)艦5000余艘。

順治十五年（1658年）五月，接受吏官淵庚鐘、工官馮澄世、參軍陳永華等人的建議，鄭成功率17萬大軍開始浩蕩北伐。他的目的地是南京。作為明朝開國(guó)京城以及南明政權(quán)的定都之地，南京在鄭成功心目無疑有著非常特殊的地位，如果能夠攻下南京，并且再趁機(jī)收復(fù)長(zhǎng)江中下游一帶的廣闊地區(qū)，即可以憑半壁江山與清對(duì)峙。