1907年9月，孫中山任命洪門黨人、同盟會員、壯族起義首領(lǐng)黃明堂為“中華國民軍鎮(zhèn)南關(guān)都督”。鎮(zhèn)南關(guān)其實是個重要的戰(zhàn)略要地，是中越邊界的要塞,當(dāng)時有“第二旅順口”之稱,。12月2日，黃明堂、關(guān)仁甫率領(lǐng)鄉(xiāng)勇80人，攜帶快槍42支，從越南潛襲中越邊境重鎮(zhèn)鎮(zhèn)南關(guān)。鎮(zhèn)南關(guān)有四個炮臺。黃明堂事前與守炮臺的清軍取得聯(lián)系，約訂2日由山背間縋繩直入，直取第三炮臺。起義軍跨越斷澗危崖，吶喊而入。守兵百余人略作抵抗，就投降了，第二炮臺、第一炮臺也相繼被革命黨人奪得。清軍只剩下東邊的一個炮臺。黃明堂派了40人左右持續(xù)攻擊，被該炮臺的炮火所阻擋。

第二天，孫中山親率黃興、胡漢民、日本人池亨吉、法國退職炮兵上尉狄氏等人，從河內(nèi)出發(fā)，乘火車到最后一站同登，走小路步行登山，在當(dāng)天晚上九點左右到達鎮(zhèn)南關(guān)。第二天，清軍援軍開到，發(fā)起攻擊，孫中山在陣地為傷員包扎，并在法國退役上尉的協(xié)助下親自發(fā)炮，竟打得很準，他慨言道：“反對清政府二十余年，此日始得親發(fā)炮擊清軍耳！”當(dāng)日下午，清軍的巡防統(tǒng)領(lǐng)陸榮廷派一砍柴的婦人持函登臺，信里說：“榮廷現(xiàn)雖食清朝俸祿，但以前亦曾統(tǒng)率游勇，專與清兵為敵，此公等所知者。榮廷前以時運不佳，不得已暫時屈身異族，以俟機會。區(qū)區(qū)此心，尚祈諒之!榮廷初疑公等此次起事，近于輕舉妄動，及觀爭晨炮火之猛烈，乃知有一代豪杰孫逸仙先生為公等畫策，無任欽佩?！标憳s廷還說：“榮廷現(xiàn)有眾六百余人，隨時可以投入麾下，以供驅(qū)使。倘荷錄用，即請給一確證，俾得知所去就。若至明日，則有清軍五百自憑祥開來，后日更有清軍二千自龍州開來。事急萬分，祈為自重。”

得到這個消息，孫中山便決定回河內(nèi)籌款籌械，命黃明堂堅守5日，等餉械一到，便進取龍州。當(dāng)晚，孫中山、黃興、胡漢民等人下山，半夜到達“文煙”，住在革命黨人瑪邯家里。后來又乘車回到河內(nèi)，孫中山開始籌餉購械。有一位法國銀行家對孫中山說，愿意為其代募革命軍債二千萬元巨款，孫中山很高興，但是銀行家又說，第一批的款項要等到革命軍攻下龍州以后才能交付。孫中山繼續(xù)爭取，希望能立刻得到一筆錢，但是這位銀行家堅決不答應(yīng)。7日，清政府軍機處將失去鎮(zhèn)南關(guān)的張鳴歧“交部議處”，又命他戴罪立功“即日克復(fù)”。清軍以4000人的兵力圍攻。當(dāng)夜，曾經(jīng)向?qū)O中山表示善意的陸榮廷向革命軍猛撲，黃明堂堅持數(shù)日，槍彈告罄，于8日夜丟棄炮臺，率殘部退至安南燕子大山。但是清軍中有不少人在這個時候還表示可以投降，但是需要得到一大筆錢。他們甚至派出代表到越南跟孫中山談判，孫中山讓他們攜帶武器投降，等到打下南寧，每人賞銀一百元。他們卻要求每人在投降之時，就能先得到三十元。對于這個條件，孫中山答應(yīng)了，但是他沒有錢。

清政府已經(jīng)通過外交渠道向法國政府提出交涉，要求把孫中山驅(qū)逐出越南。孫中山在河內(nèi)的住址甘必達街六十一號，清政府的情報人員已經(jīng)探知。越南總督便勸告孫中山主動離境。孫中山把粵、桂、滇三省的革命工作交給了黃興與胡漢民，1908年開會離開了越南，去往新加坡。