1939年9月，第二次世界大戰(zhàn)爆發(fā)。年底，蔣介石掀起第一次反共高潮，令胡宗南部隊(duì)向陜甘寧邊區(qū)發(fā)動(dòng)進(jìn)攻……這一切，使得一直靠拉共產(chǎn)黨對(duì)抗國(guó)民黨的盛世才，感到自己的羽翼已經(jīng)豐滿(mǎn)，有機(jī)可乘，政治態(tài)度變得強(qiáng)硬起來(lái)。在迪化乃至全疆，反蘇反共的空氣日趨濃烈。

在陳潭秋接任中共駐新疆代表，主持八路軍駐新疆辦事處工作后，曾多次約會(huì)盛世才。盛世才總是借口忙，予以拒絕。陳潭秋敏感地意識(shí)到，新疆上空已經(jīng)烏云滾滾，一場(chǎng)突然襲來(lái)的暴風(fēng)雨將不可避免。鑒于“新兵營(yíng)”的學(xué)習(xí)已經(jīng)基本結(jié)束，同志們強(qiáng)烈要求奔赴抗日前線，為預(yù)防不測(cè)，陳潭秋立即報(bào)請(qǐng)黨中央，盡快將這些同志送回延安。1940年2月5日，300多位“新兵營(yíng)”官兵歷經(jīng)艱辛，勝利地回到黨中央的懷抱。

就在這時(shí)，在蘇聯(lián)學(xué)習(xí)、養(yǎng)病的毛澤民離開(kāi)莫斯科回到迪化。臨行前，在中國(guó)黨校學(xué)習(xí)的楊至成等幾位紅軍老戰(zhàn)友都勸毛澤民回延安。毛澤民謝絕了同志們的好意。他深知自己的影響和肩上的責(zé)任。義無(wú)反顧地踏上返回新疆的行程。

回到迪化后，毛澤民一方面立即展開(kāi)建設(shè)新新疆的藍(lán)圖，把在蘇聯(lián)學(xué)到的先進(jìn)經(jīng)驗(yàn)，盡可能多地用于新疆的經(jīng)濟(jì)建設(shè)，造福各族人民，一方面也更加關(guān)注時(shí)局，關(guān)心中共在新人員的安危。他和陳潭秋送走了一批又一批自己的同志和黨外民主人士，而他們自己卻在險(xiǎn)惡的環(huán)境中毫不畏懼地堅(jiān)守著。

1941年6月，蘇德戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)后，蔣介石加緊了奪取新疆的進(jìn)程，并采取軟硬兼施的辦法逼盛世才就范。他首先令胡宗南部接替馬家軍的防務(wù)，用武力威脅新疆，隨后又三次召見(jiàn)盛世才駐重慶代表張?jiān)?，提出談判的條件。

而此時(shí)，世界反法西斯戰(zhàn)爭(zhēng)和中國(guó)的抗日戰(zhàn)爭(zhēng)都處在異常艱苦的階段。一向標(biāo)榜“國(guó)際問(wèn)題看莫斯科，國(guó)內(nèi)問(wèn)題看延安”的盛世才，認(rèn)為“蘇聯(lián)靠不住了”，“中共也要垮臺(tái)了”，于是，更加快了反蘇反共、投靠蔣介石的步伐。他先是借口毛澤民身體不好，需要半休，將他調(diào)離了財(cái)政廳，改任民政廳代理廳長(zhǎng)；后又在新疆炮制了一系列所謂“陰謀暴動(dòng)案”的同時(shí)，加緊特務(wù)活動(dòng)，將反共矛頭首先指向毛澤民。