1900年閏八月，孫中山發(fā)動(dòng)對(duì)清廷的第二次打擊，即庚子惠州之役。鄭士良發(fā)難于惠州，屢挫清軍，旋以外援不繼潰退，此事早在這年的春天就在策劃了。自從五年前的廣州起義失敗，孫中山和鄭士良等人，便在策劃新的反清武裝起義。孫中山派鄭士良前往廣東惠州聯(lián)絡(luò)會(huì)黨發(fā)動(dòng)起義，又派史堅(jiān)如到廣州策動(dòng)，他自已則從日本到香港，準(zhǔn)備潛入內(nèi)地領(lǐng)導(dǎo)起義。但香港殖民當(dāng)局不準(zhǔn)他登岸，只好又折回日本轉(zhuǎn)渡臺(tái)灣，打算再?gòu)呐_(tái)灣潛入內(nèi)地。到了農(nóng)歷六月份，孫中山在新加坡，本欲聯(lián)絡(luò)康有為一起起義，反被康氏陷害，于是聯(lián)絡(luò)又流產(chǎn)了。孫中山先生于是回到香港，在商議之時(shí)，日本志士建議乘夜晚從九龍上岸，火速進(jìn)入內(nèi)地，以神風(fēng)突擊之勢(shì)襲擊廣州。中山先生不同意此項(xiàng)策劃，以為不過(guò)飛蛾撲火。到了公歷10月8日，孫中山派日本志士山田良政赴海陸豐發(fā)動(dòng)起義。八月十三日（1900年10月6日），鄭士良在惠州三洲田（今深圳鹽田區(qū)的三洲田）率三合會(huì)眾六百多人起義，以黃福為元帥，鄭士良、何松為參謀，黃耀庭、廖慶發(fā)、林海山為先鋒，分兩路出發(fā)。東路從馬巒村、金龜洞出禾崗，打新圩，直撲鎮(zhèn)隆，在佛子坳伏擊清軍取得大捷；西路從橫崗出沙灣攻打蘭花廟，大獲全勝，進(jìn)一步攻打深圳、南頭受阻。東路義軍在永湖、崩岡圩連戰(zhàn)皆捷，勢(shì)如破竹，22日乘勝進(jìn)入三多祝，在白沙扎營(yíng)，隊(duì)伍迅速發(fā)展到兩萬(wàn)人，其中不少是富有革命傳統(tǒng)的當(dāng)?shù)乜图胰耍晞?shì)浩大。后因形勢(shì)急劇變化，原擬突擊至廈門(mén)時(shí)獲得接濟(jì)的計(jì)劃無(wú)法實(shí)現(xiàn)，后援不繼，陷入困境，孫中山電令鄭士良可自決進(jìn)止，義軍不得不解散，剩下千余洋槍手分水陸兩路返回三洲田，至11月7日無(wú)奈解散。

此次起義半月內(nèi)都很順利，到了下旬，因糧食武器失去后援，被迫解散。從打擊的力度來(lái)看如果糧餉充足，則事情很可能大有可為。起義軍進(jìn)擊途中，孫中山先生曾緊急致函日本友人，談到武器的問(wèn)題有謂：“若今得洋銃萬(wàn)桿，野炮十門(mén)，則取廣州如反掌之易耳?！绷x軍解散后，鄭士良率部分人馬退回香港，山田政良被清軍捕獲，旋即殺害。孫中山先生稱(chēng)之為“外國(guó)義士為中國(guó)共和犧牲者之第一人”。

這次起義雖然失利，但對(duì)民間的觀念大有影響。先是輿論對(duì)革命者稱(chēng)為亂臣賊子，大逆不道，多所咒罵；這次起義途中與民交流甚多，深得民心，所以失敗后民間對(duì)此事大為嘆惋，但恨其事不成。