顧允成，字季時，憲成的弟弟。性情耿直，注重名節(jié)。參加萬歷十一年(1583)會試，十四年才赴殿試。對策中有這樣的話：“陛下因為鄭妃勤于奉侍，冊封為皇貴妃，朝廷大臣私下?lián)牟灰?。請求冊立太子，晉封王恭妃，不是得不到皇上答復就是立刻被斥退。不幸鄭貴妃擅威弄權，她的親戚左右大張其勢，內(nèi)廷、外廷之害多得不得了。不久張居正欺上專權，陛下認為他不可信，把朝政托付給二三個小人。恐怕張居正的專權，還與陛下不一致。而這些人專權，只給了陛下一致。不一致則容易抓空隙，予以調(diào)整，一致則難于插手挽救?！眻?zhí)掌朝政的大驚而且憤恨，把他排在末名。

　　正好南畿督學御史德清人房寰，連連上疏詆毀都御史海瑞，顧允成氣憤異常。與同年生彭遵古、諸壽賢上疏彈劾他，大意說：“房寰嫉妒賢明、丑化正直的人，不知道人間的廉恥。我等自幼讀書，就知道仰慕海瑞，認為他是當代偉人。房寰大肆貪污，聽說海瑞的風范，應當羞愧而死，反而敢制造謠言誣陷，我等深表痛心。因而彈劾他欺君罔上的七大罪狀。”房寰奏疏剛上時，朝野之士恨得咬牙切齒。而政府庇護他，僅僅擬定圣旨責怪了他。等到得到顧允成等的奏疏，說房寰已遭到嚴厲的責備，不應當出格妄自上奏，奪去三人的官服，回家自省，而且命令九卿約束辦事進士，不要擅自議論朝政。南京太仆卿沈思孝上疏說：“二三年來，今天以建議防人，明天以越職加人罪，而且告誡諸部門加以約束，進士議論時政的，命令堂官管制。禁止大臣作奸犯法是可以的，反過來卻禁止大臣直言勸諫；教他們磨礪德行、樹立名節(jié)是可以的，想不到反過來教大臣保持沉默以取得寵幸。這個風氣一開，弊端的盡頭是哪兒呢？御史為避開禍害希望得到寵愛不再說什么，一般官吏又不應該說；大臣持有俸祿不說，小臣又不許說。萬一奸臣擅權，危及宗廟、社稷，陛下怎么能聽到呢？我遍考前朝的舊事，練綱、鄒智、孫磐、張璁都是以書生向朝廷建議，沒有聽說有罪，為什么獨獨禁錮顧允成呢？”奏疏進入內(nèi)宮，因違背圣旨被責備，三個人遂被除去官籍。房寰又詆毀海瑞和沈思孝，其言狂妄到了極點。從而得罪了清議，貶為江西副使。給事中張鼎思彈劾他的奸詐與貪污，房寰也攻擊張鼎思私人請托一事。各位給事中紛紛不平，連上奏章攻擊房寰，房寰與張鼎思同時被貶，再也沒有振作起來。

　　很久以后，南京御史陳邦科請求錄用顧允成等，皇上不答應。巡按御史又說到此事，皇上下詔許他作為教授使用。顧允成在南康、保定任教授。后為國子監(jiān)博士，升為禮部主事。三位皇子一同封王的命令下達，顧允成與同官張納陛、工部主事岳元聲合作上疏勸諫說：“冊立大典，近年來沒有再敢褻瀆的，因為已奉有二十一年頒行的明令詔書。今天已到期，群臣沒有不殷切盼望的。而首席輔臣王錫爵星夜趕到朝廷，見到禮部尚書羅萬化、儀制郎于孔兼，就告誡他們不要說，慷慨獨自擔當。我等實在感到欣慰。不想陛下拿出禁中密札，竟然給了王錫爵私人，三王同時分封的朝議于是達成。即使次輔臣趙志皋、張位也沒有預先聽說，天下的事并不是一家的私事，長子封為王，祖宗以來沒有這樣的規(guī)矩，王錫爵怎么能獨自專斷，陛下怎能開創(chuàng)這一先例呢？”當時，光祿丞朱維京、給事中王如堅的奏疏先呈上，皇上震怒，讓他們到邊境去戍守。朱維京的同官涂杰、王學曾接著上疏，被斥退為百姓。到這時，勸諫者更加多，皇上知道不可以全部斥退，只是回答“按照圣旨行事”。不久竟然停止。

　　沒有多久，吏部尚書孫钅龍等因為過失被責怪。顧允成認為張位實主使其事，上疏極力攻擊張位，牽涉到王錫爵。納陛也上疏極力辯論，并涉及到執(zhí)掌朝政的人?；噬习l(fā)了脾氣，將顧允成貶為光州判官，納陛貶為鄧州判官。他們倆都乞求告假回鄉(xiāng)，不再出來做官。