ggplot2科技繪圖：基于R語(yǔ)言的數(shù)據(jù)可視化

第1章　R語(yǔ)言基礎(chǔ)1
1.1　R語(yǔ)言概述1
1.1.1　R語(yǔ)言的誕生1
1.1.2　R語(yǔ)言的特點(diǎn)2
1.1.3　R語(yǔ)言繪圖系統(tǒng)2
1.1.4　圖形語(yǔ)法3
1.2　搭建R語(yǔ)言環(huán)境4
1.2.1　安裝程序的下載4
1.2.2　R語(yǔ)言的安裝與啟動(dòng)6
1.2.3　輔助工具Rstudio8
1.2.4　包的安裝與加載10
1.3　對(duì)象與變量14
1.3.1　對(duì)象14
1.3.2　變量15
1.4　數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)16
1.4.1　數(shù)據(jù)類型16
1.4.2　向量18
1.4.3　矩陣與數(shù)組22
1.4.4　數(shù)據(jù)框24
1.4.5　列表27
1.4.6　因子29
1.5　基本運(yùn)算30
1.6　獲取幫助信息32
1.6.1　使用內(nèi)置幫助函數(shù)32
1.6.2　獲取自帶數(shù)據(jù)集信息33
1.6.3　R語(yǔ)言相關(guān)軟件和資料34
1.7　本章小結(jié)34
第2章　數(shù)據(jù)基本操作35
2.1　管道操作35
2.2　數(shù)據(jù)存取38
2.2.1　讀入R格式數(shù)據(jù)38
2.2.2　讀取CSV/TXT格式數(shù)據(jù)40
2.2.3　讀取Excel格式數(shù)據(jù)42
2.2.4　保存數(shù)據(jù)43
2.3　數(shù)據(jù)連接44
2.3.1　merge()函數(shù)44
2.3.2　cbind()函數(shù)與
rbind()函數(shù)45
2.3.3　dplyr包的連接函數(shù)47
2.4　數(shù)據(jù)抽樣49
2.4.1　生成隨機(jī)數(shù)49
2.4.2　隨機(jī)抽樣50
2.4.3　系統(tǒng)抽樣50
2.4.4　分層抽樣51
2.5　數(shù)據(jù)塑形55
2.5.1　寬數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為長(zhǎng)數(shù)據(jù)55
2.5.2　長(zhǎng)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為寬數(shù)據(jù)58
2.5.3　分割列60
2.5.4　合并列62
2.6　缺失值與空值處理63
2.6.1　缺失值63
2.6.2　空值66
2.7　本章小結(jié)68
第3章　ggplot2繪圖系統(tǒng)69
3.1　基本語(yǔ)法69
3.1.1　ggplot2語(yǔ)法框架70
3.1.2　數(shù)據(jù)和圖形屬性映射72
3.1.3　創(chuàng)建幾何對(duì)象76
3.1.4　添加統(tǒng)計(jì)變換84
3.2　坐標(biāo)系統(tǒng)88
3.2.1　笛卡兒坐標(biāo)系88
3.2.2　極坐標(biāo)系90
3.2.3　地理坐標(biāo)系91
3.3　圖形分面93
3.4　標(biāo)度函數(shù)96
3.4.1　顏色標(biāo)度函數(shù)97
3.4.2　坐標(biāo)標(biāo)度函數(shù)104
3.5　主題函數(shù)113
3.6　保存圖形118
3.7　本章小結(jié)118
第4章　注釋與頁(yè)面布局119
4.1　添加注釋119
4.1.1　添加文本注釋120
4.1.2　通過(guò)嵌套為圖形做注釋123
4.1.3　為坐標(biāo)軸添加對(duì)數(shù)
刻度線124
4.2　頁(yè)面布局126
4.2.1　利用patchwork包126
4.2.2　利用gridExtra包131
4.3　本章小結(jié)134
第5章　創(chuàng)建基本圖表135
5.1　散點(diǎn)圖135
5.2　折線圖140
5.3　柱狀圖143
5.4　階梯圖150
5.5　等高線圖152
5.6　核密度圖155
5.7　面積圖160
5.8　頻率多邊圖162
5.9　柵格圖164
5.10　本章小結(jié)168
第6章　創(chuàng)建統(tǒng)計(jì)圖表169
6.1　直方圖169
6.2　二維直方圖172
6.3　箱線圖175
6.4　小提琴圖181
6.5　分組點(diǎn)圖184
6.6　添加誤差條188
6.7　本章小結(jié)193
第7章　添加幾何元素到圖表194
7.1　指定參考線194
7.2　添加隨機(jī)抖動(dòng)197
7.3　平滑線200
7.4　垂直線203
7.5　帶狀圖205
7.6　區(qū)間線段207
7.7　多邊形209
7.8　文本標(biāo)簽211
7.9　邊緣短線214
7.10　空幾何對(duì)象216
7.11　本章小結(jié)218
第8章　統(tǒng)計(jì)變換繪圖219
8.1　繪制直方圖和頻率折線圖219
8.2　繪制條形圖222
8.3　繪制密度曲線224
8.4　繪制置信橢圓227
8.5　繪制等高線圖229
8.6　繪制箱線圖231
8.7　添加平滑曲線234
8.8　繪制經(jīng)驗(yàn)累積分布函數(shù)圖237
8.9　繪制Q-Q圖239
8.10　繪制分位數(shù)線242
8.11　繪制數(shù)學(xué)函數(shù)圖244
8.12　繪制重復(fù)點(diǎn)數(shù)量圖246
8.13　繪制數(shù)據(jù)中的唯一值249
8.14　顯示原始數(shù)據(jù)251
8.15　其他統(tǒng)計(jì)變換函數(shù)253
8.16　本章小結(jié)255
第9章　標(biāo)度256
9.1　標(biāo)度概述256
9.2　顏色標(biāo)度257
9.2.1　顏色標(biāo)度函數(shù)匯總257
9.2.2　調(diào)色板參數(shù)設(shè)置260
9.2.3　RColorBrewer調(diào)色板262
9.3　坐標(biāo)標(biāo)度266
9.4　透明度標(biāo)度268
9.5　點(diǎn)形狀標(biāo)度272
9.6　點(diǎn)大小/線粗細(xì)標(biāo)度275
9.7　線型標(biāo)度278
9.8　線寬標(biāo)度281
9.9　本章小結(jié)284
第10章　拓展包ggpubr285
10.1　ggpubr概述285
10.2　快速創(chuàng)建圖表288
10.2.1　點(diǎn)圖288
10.2.2　散點(diǎn)圖290
10.2.3　密度圖293
10.2.4　箱線圖295
10.2.5　小提琴圖297
10.2.6　直方圖299
10.2.7　便捷繪圖函數(shù)匯總302
10.3　添加統(tǒng)計(jì)標(biāo)記307
10.3.1　添加回歸線和
相關(guān)系數(shù)308
10.3.2　添加顯著性標(biāo)記309
10.3.3　手動(dòng)添加顯著性
標(biāo)記313
10.3.4　添加統(tǒng)計(jì)標(biāo)記函數(shù)
匯總315
10.4　圖形美化和調(diào)整316
10.4.1　排列多幅圖316
10.4.2　調(diào)整圖例、標(biāo)題和
坐標(biāo)軸標(biāo)簽318
10.4.3　添加注釋和文本321
10.4.4　導(dǎo)出圖形323
10.5　本章小結(jié)326
第11章　其他拓展包327
11.1　主題包（ggthemes）327
11.2　峰巒圖（ggridges）330
11.3　水平條形圖（ggHoriPlot）332
11.4　相關(guān)矩陣圖（ggcorrplot）338
11.5　添加統(tǒng)計(jì)注釋（ggstatsplot）340
11.6　生存分析（ggsurvfit）347
11.7　蜂群圖（ggbeeswarm）351
11.8　跟蹤點(diǎn)/線（ggtrace）353
11.9　馬賽克圖（ggmosaic）357
11.10　本章小結(jié)360