藥物生物信息學

章　生物信息學概述
　節(jié)　生物信息學及其發(fā)展
　第二節(jié)　生物信息學的研究領域
　第三節(jié)　生物信息學在藥學領域的應用
　參考文獻
第二章　計算機網(wǎng)絡基礎
　節(jié)　Internet簡介
　第二節(jié)　Internet提供的服務
　第三節(jié)　搜索引擎及其使用
　參考文獻
第三章　核酸序列及基因組數(shù)據(jù)庫
　節(jié)　核酸序列數(shù)據(jù)庫
　第二節(jié)　基因組與功能基因組數(shù)據(jù)庫
　參考文獻
第四章　蛋白質(zhì)序列及結構數(shù)據(jù)庫
　節(jié)　蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫
　第二節(jié)　蛋白質(zhì)序列復合數(shù)據(jù)庫
　第三節(jié)　蛋白質(zhì)結構數(shù)據(jù)庫
　第四節(jié)　蛋白質(zhì)結構分類數(shù)據(jù)庫
　參考文獻
第五章　生物醫(yī)學信息檢索
　節(jié)　集成式數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)
　第二節(jié)　生物醫(yī)藥文獻資源
　參考文獻
第六章　序列比對方法和相似性搜索
　節(jié)　概述
　第二節(jié)　雙重序列比對
　第三節(jié)　多序列比對
　第四節(jié)　點陣作圖法
　第五節(jié)　序列比對的統(tǒng)計學顯著性
　第六節(jié)　數(shù)據(jù)庫中的相似性搜索
　參考文獻
第七章　核酸序列分析
　節(jié)　基因結構分析
　第二節(jié)　核酸序列組裝和基因定位分析
　第三節(jié)　新基因的發(fā)現(xiàn)及功能預測
　參考文獻
第八章　蛋白質(zhì)序列分析
　節(jié)　蛋白質(zhì)組成及基本性質(zhì)
　第二節(jié)　蛋白質(zhì)二級結構預測
　第三節(jié)　特殊結構或結構特征分析
　第四節(jié)　蛋白質(zhì)三級結構預測
　參考文獻
第九章　新藥開發(fā)中的生物信息學軟件
　節(jié)　概述
　第二節(jié)　PCR引物設計及其軟件介紹
　第三節(jié)　DNA序列分析軟件
　第四節(jié)　蛋白質(zhì)列分析軟件
　第五節(jié)　序列比對軟件
　第六節(jié)　RNA結構預測及其軟件介紹
　第七節(jié)　生物信息軟件的工業(yè)標準GCG簡介
　第八節(jié)　生物分子與建模軟件InsightⅡ
　參考文獻
第十章　計算機輔助藥物設計
　節(jié)　生物信息學與藥物設計
　第二節(jié)　先導化合物的計算機輔助設計
　第三節(jié)　先導化合物的計算機輔助優(yōu)化
　第四節(jié)　新型多肽及蛋白質(zhì)分子設計
　參考文獻
第十一章　計算機輔助疫苗設計
　節(jié)　免疫學基本概念
　第二節(jié)　免疫應答
　第三節(jié)　抗原表位預測方法
　第四節(jié)　計算機輔助疫苗設計相關軟件及應用
　參考文獻
第十二章　生物芯片技術
　節(jié)　基因芯片
　第二節(jié)　蛋白質(zhì)芯片
　第三節(jié)　生物芯片技術在新藥研究中的應用
　第四節(jié)　生物芯片與生物信息學
　參考文獻
第十三章　藥物基因組學
　節(jié)　藥物基因組學的發(fā)展
　第二節(jié)　藥物基因組學的研究內(nèi)容和方法
　第三節(jié)　藥物基因組學的應用前景
　參考文獻
附1　生物信息學大事記
附2　FASTA和BLAST搜索參考
附3　生物信息學常用數(shù)據(jù)庫