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內(nèi)容簡(jiǎn)介

　　本書致力于系統(tǒng)地介紹網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的理論、方法和應(yīng)用的研究進(jìn)展，主要包括四大部分：1）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)涉及的概念與理論；2）常用分析方法、數(shù)據(jù)庫與分析軟件；3）基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的中醫(yī)藥現(xiàn)代化、現(xiàn)代藥物研究的典型案例；4）基于藥物、疾病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)實(shí)踐流程。適用于初接觸網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、需要系統(tǒng)了解該領(lǐng)域的研究人員和學(xué)生。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是人工智能和大數(shù)據(jù)時(shí)代藥物系統(tǒng)性研究的新興前沿學(xué)科，也是融合系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)、網(wǎng)絡(luò)科學(xué)、系統(tǒng)藥理學(xué)等學(xué)科的原創(chuàng)性學(xué)科，強(qiáng)調(diào)從系統(tǒng)層次和生物網(wǎng)絡(luò)的整體角度出發(fā)，解析藥物及其治療對(duì)象之間的分子關(guān)聯(lián)規(guī)律，揭示藥物的系統(tǒng)性藥理機(jī)制，指導(dǎo)新藥研發(fā)和臨床治療。隨著計(jì)算、實(shí)驗(yàn)方法的進(jìn)步，網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)展將有望幫助系統(tǒng)理解藥物和病證的相互作用關(guān)系，為藥物研發(fā)、機(jī)制闡釋、藥效評(píng)價(jià)、精準(zhǔn)用藥等提供技術(shù)支撐，促進(jìn)從“還原論”到“系統(tǒng)論”的方法論革新，為“下一代藥物研究模式”的推廣應(yīng)用提供強(qiáng)勁動(dòng)力。

作者簡(jiǎn)介

　　李梢，清華大學(xué)長聘教授、北京市中醫(yī)藥交叉研究所所長、英國皇家化學(xué)會(huì)會(huì)士、英國皇家生物學(xué)會(huì)會(huì)士、國家杰青、國家萬人計(jì)劃領(lǐng)軍人才、世界中醫(yī)藥學(xué)會(huì)聯(lián)合會(huì)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)專委會(huì)會(huì)長、中國生物工程學(xué)會(huì)生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)專委會(huì)主任委員。為中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)開拓者、胃癌極早期防治體系創(chuàng)建者。發(fā)表論文200余篇，被Nature、Science、Cell等引用9000余次，授權(quán)發(fā)明專利23項(xiàng)，領(lǐng)銜制定網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)首個(gè)國際標(biāo)準(zhǔn)。連續(xù)四年入選全球前2%頂尖科學(xué)家，獲中醫(yī)藥國際貢獻(xiàn)獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)、李時(shí)珍醫(yī)藥創(chuàng)新獎(jiǎng)、中國全面小康十大杰出貢獻(xiàn)人物，以及多項(xiàng)國家和省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)。

圖書目錄

第1章網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)理論與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)
1.1網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)：下一代藥物研究模式
1.2中醫(yī)藥在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)起源和發(fā)展中的關(guān)鍵作用
1.3網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)核心理論：網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)
1.3.1網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)理論的提出與發(fā)展
1.3.2網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)的概念
1.4網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究模式和特點(diǎn)概述
1.4.1“單靶標(biāo)局部對(duì)抗”研究模式
1.4.2“網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)系統(tǒng)調(diào)節(jié)”研究模式
1.4.3網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析典型場(chǎng)景
1.4.4網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究特點(diǎn)、挑戰(zhàn)及發(fā)展方向
參考文獻(xiàn)
第2章基于人工智能算法的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在藥物研發(fā)中的應(yīng)用
2.1運(yùn)用于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的人工智能方法介紹
2.1.1人工智能算法簡(jiǎn)介
2.1.2人工智能算法性能評(píng)價(jià)方法
2.1.3人工智能方法應(yīng)用條件
2.1.4人工智能方法的前沿和展望
2.2人工智能在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中的應(yīng)用
2.2.1藥物靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)和發(fā)現(xiàn)
2.2.2藥物作用機(jī)制的研究
2.2.3藥物新用途的發(fā)現(xiàn)
2.2.4中藥物質(zhì)基礎(chǔ)與中醫(yī)治療理論的研究
2.3人工智能方法的應(yīng)用展望
參考文獻(xiàn)
第3章網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用數(shù)據(jù)庫
3.1網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫
3.1.1ETCM：中醫(yī)藥百科全書
3.1.2SymMap：關(guān)注證候關(guān)聯(lián)的中醫(yī)藥整合數(shù)據(jù)庫
3.1.3BATMANTCM：中藥分子機(jī)制的生物信息學(xué)分析平臺(tái)
3.1.4TCMID：用于中藥分子機(jī)制分析的中醫(yī)藥整合數(shù)據(jù)庫
3.1.5其他中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫
3.2網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用生物相關(guān)數(shù)據(jù)庫
3.2.1OMIM：人類孟德爾遺傳病在線數(shù)據(jù)庫
3.2.2HPO：人類表型本體數(shù)據(jù)庫
3.2.3DisGeNET：疾病基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫
3.2.4MalaCards：疾病信息數(shù)據(jù)庫
3.3網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用靶標(biāo)相關(guān)數(shù)據(jù)庫
3.3.1TTD：治療靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫
3.3.2PDB：蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
3.3.3GeneCards：基因信息數(shù)據(jù)庫
3.3.4KEGG：京都基因與基因組百科全書
3.4網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.1BioGRID：生物學(xué)通用相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.2DIP：蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.3IntAct：分子相互作用數(shù)據(jù)庫
3.4.4STRING：基因/蛋白相互作用關(guān)系數(shù)據(jù)庫
參考文獻(xiàn)
第4章網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用軟件
4.1網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)軟件功能框架及分類
4.1.1總體軟件功能需求
4.1.2網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)軟件功能框架及分類
4.2網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用的Web軟件
4.2.1藥物靶標(biāo)預(yù)測(cè)Web軟件
4.2.2藥物適應(yīng)癥分析Web軟件
4.2.3基因功能富集分析Web軟件
4.2.4蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建Web軟件
4.3基于圖形化界面操作的軟件
4.3.1差異基因富集分析軟件
4.3.2網(wǎng)絡(luò)分析軟件
4.4基于編程語言的工具包
4.4.1C 、Java工具包的使用
4.4.2Python、R工具包的使用
參考文獻(xiàn)
第5章網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究案例
5.1網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與中醫(yī)證候研究案例
5.1.1寒、熱證候及對(duì)證方劑的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究案例分析
5.1.2慢性乙型肝炎致肝纖維化的“同病異證”研究案例分析
5.2網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與中藥方劑研究案例
5.3網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與中藥創(chuàng)制研究案例
5.4網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與民族藥研究案例
參考文獻(xiàn)
第6章網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與現(xiàn)代藥物研發(fā)案例
6.1復(fù)雜疾病內(nèi)在機(jī)制和干預(yù)靶標(biāo)
6.2藥物系統(tǒng)性作用機(jī)制
6.3多靶標(biāo)藥物研發(fā)
6.3.1缺血性中風(fēng)：從單一藥物靶標(biāo)到協(xié)同的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)
6.3.2聯(lián)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與表型篩選開發(fā)新的止痛類藥物
6.4藥物重新定位
6.4.1基于網(wǎng)絡(luò)的藥物重定位預(yù)測(cè)及基于人群的驗(yàn)證
6.4.2基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的藥物重定位發(fā)現(xiàn)新的抗抑郁藥物
6.5組合藥物研發(fā)
參考文獻(xiàn)
第7章基于藥物的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)實(shí)踐流程
7.1尋找單味中藥或方劑的有效成分
7.1.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.1.2網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與可視化
7.1.3網(wǎng)絡(luò)分析與預(yù)測(cè)
7.1.4驗(yàn)證與總結(jié)
7.2闡述單味中藥或方劑的藥效機(jī)制
7.2.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.2.2網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與可視化
7.2.3網(wǎng)絡(luò)分析與預(yù)測(cè)
7.2.4驗(yàn)證與總結(jié)
7.3詮釋中藥配伍理論的科學(xué)內(nèi)涵
7.3.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.3.2網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與可視化
7.3.3網(wǎng)絡(luò)分析與預(yù)測(cè)
7.3.4驗(yàn)證與總結(jié)
7.4解釋中藥與西藥之間的相互作用
7.4.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.4.2網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與可視化
7.4.3網(wǎng)絡(luò)分析與預(yù)測(cè)
7.4.4驗(yàn)證與總結(jié)
7.5藥物臨床應(yīng)用的重定位——中藥成分保護(hù)腦缺血再灌注損傷的新用途
7.5.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.5.2網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與可視化
7.5.3網(wǎng)絡(luò)分析與預(yù)測(cè)
7.5.4驗(yàn)證與總結(jié)
7.6多靶點(diǎn)藥物的開發(fā)——中藥配伍保護(hù)低密度脂蛋白誘導(dǎo)的內(nèi)皮細(xì)胞
損傷
7.6.1數(shù)據(jù)采集與處理
7.6.2網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與可視化
7.6.3網(wǎng)絡(luò)分析與預(yù)測(cè)
7.6.4驗(yàn)證與總結(jié)
參考文獻(xiàn)
第8章基于疾病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)實(shí)踐流程
8.1冠心病疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析
8.1.1數(shù)據(jù)采集與處理
8.1.2網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與可視化
8.1.3網(wǎng)絡(luò)分析與預(yù)測(cè)
8.1.4驗(yàn)證與總結(jié)
8.2疾病網(wǎng)絡(luò)用于中藥方劑的研究實(shí)踐
8.2.1中藥方劑的整合作用機(jī)制研究
8.2.2中藥方劑的“君臣佐使”配伍規(guī)律研究
8.2.3中藥方劑的“益氣、活血”功效研究
參考文獻(xiàn)
第9章基于藥物疾病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)實(shí)踐流程
9.1化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究
9.1.1化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的作用靶點(diǎn)預(yù)測(cè)
9.1.2化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的作用靶點(diǎn)驗(yàn)證
9.1.3化橘紅治療呼吸系統(tǒng)疾病的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
9.2丹紅注射液治療心血管疾病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究
9.2.1丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點(diǎn)預(yù)測(cè)
9.2.2丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點(diǎn)驗(yàn)證
9.2.3丹紅注射液治療心血管疾病的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
參考文獻(xiàn)
附錄A網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)評(píng)價(jià)方法指南
附錄B網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)評(píng)價(jià)要素與評(píng)價(jià)指標(biāo)
附錄C網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究報(bào)告示例
后記