淡水紅藻代表類群葉綠體基因的適應性進化

　　淡水紅藻對生境的要求較高，大部分種類生活在潔凈流動的水體中，也有少數(shù)種類分布在靜止水體如湖水和池塘中。由于淡水紅藻對水質(zhì)要求較高，隨著水環(huán)境污染的日益加重，其生存受到嚴重威脅，好多種類已被歐洲國家列為瀕危物種。淡水紅藻在漫長的進化歷史中，其演化歷程與生存環(huán)境相互作用，一部分遺傳信息的改變經(jīng)過自然選擇被固定了下來，發(fā)生基因的適應性進化。對具有重要功能蛋白質(zhì)的編碼基因進行適應性進化分析，能夠揭示基因的變異和蛋白結(jié)構(gòu)與功能的改變與淡水紅藻進化史的關(guān)系。本研究選擇了1，5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶大亞基編碼基因rbcL、光系統(tǒng)Ⅰ反應中心（RC）跨膜復合物的中心蛋白A編碼基因psaA、光系統(tǒng)Ⅱ D1蛋白編碼基因psbA 3個重要的功能基因，通過度量核苷酸序列的非同義替換率（dN）和同義替換率（dS）的比值（ω）來判斷自然選擇對氨基酸位點的選擇壓力，以此判斷淡水紅藻主要譜系的基因適應性進化歷程。

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