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內(nèi)容簡介

　　通過多聚酶鏈式反應(yīng)（PCR）對單條的特異DNA或RNA分子進行檢測和處理的能力使得我們對生物學(xué)的了解和對其進行影響的可能性都有了革命性的改變。這項令人矚目的技術(shù)在過去的20多年來不斷的得到了改進，提高了對目的靶點的檢出和定量能力。數(shù)字PCR是PCR技術(shù)最古老和*新的應(yīng)用，而且伴隨著可擴展的基于微滴的數(shù)字PCR的技術(shù)革新，該技術(shù)為很多研究和臨床實踐領(lǐng)域都需要進一步提高的應(yīng)用、準確度、特異性和可重復(fù)性都帶來了更大的便捷。本書將會提供一些指引，并且展示這項技術(shù)如何有助于在以下方面取得深入進展：傳染病；癌癥的進化和對治療的反應(yīng)；基因組的結(jié)構(gòu)性變化與相關(guān)表型；體細胞嵌合體的發(fā)病率；基因組編輯和細胞治療；胎兒、組織和腫瘤狀態(tài)的非侵襲性血液監(jiān)測；環(huán)境監(jiān)測；以及病原菌和轉(zhuǎn)基因的食品檢測。對于這些各不相同的應(yīng)用，本書會詳細敘述幫助使用者實現(xiàn)準確性和敏感性需求的最佳實驗設(shè)計，針對不同的靶點類型和樣品類型進行方法學(xué)設(shè)計的考慮，以及對于數(shù)據(jù)分析和解釋的深入了解。本書還會介紹與樣品劃分相關(guān)的一些其他益處，例如靶點大小的確認以及單體型分析的相關(guān)檢測。本書將會為很多專業(yè)人士提供幫助，包括與基礎(chǔ)和轉(zhuǎn)化研究相關(guān)的遺傳學(xué)家，分子生物學(xué)家，病毒學(xué)家，免疫學(xué)家，腫瘤學(xué)家，病理學(xué)家以及臨床醫(yī)生和診斷專家，還有那些對應(yīng)用和環(huán)境科學(xué)感興趣的學(xué)者。

作者簡介

　　劉毅，博士，解放軍總醫(yī)院腫瘤醫(yī)學(xué)部郭永，博士，清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系

圖書目錄

目錄
第Ⅰ部分概念背景
第1章進入21世紀分子生物學(xué)工具的神殿：數(shù)字PCR的前景 3
第2章數(shù)字PCR檢測的基本概念和驗證 9
第3章數(shù)字PCR中計算統(tǒng)計的基礎(chǔ)：只測量兩個靶點拷貝——這意味著什么 20
第4章評估血漿中循環(huán)游離DNA提取物的質(zhì)控品和數(shù)字PCR方法 35
第Ⅱ部分絕對定量
第5章用于轉(zhuǎn)基因玉米事件定量的多重微滴數(shù)字PCR方案 55
第6章采用微滴數(shù)字PCR檢測臨床樣本中人類皰疹病毒6A與6B型的共感染 77
第7章腦脊液中的生物標志物：通過數(shù)字PCR分析游離循環(huán)線粒體DNA 87
第8章在水中檢測常規(guī)和人類相關(guān)糞便的污染 99
第Ⅲ部分拷貝數(shù)變異
第9章采用微滴數(shù)字PCR分析拷貝數(shù)變異 113
第10章在血漿cfDNA中評估HER2擴增 126
第11章采用微滴數(shù)字PCR在原發(fā)體細胞組織中對嵌合體基因組DNA變異進行檢測和定量：分析嵌合體轉(zhuǎn)座元件插入、拷貝數(shù)變異和單核苷酸變異 136
第Ⅳ部分稀有突變和稀有等位基因的檢測
第12章采用微滴數(shù)字PCR在EGFR突變的肺癌患者血漿中監(jiān)測療效和耐藥 153
第13章在早期和轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者中檢測癌癥DNA 165
第14章采用微滴數(shù)字PCR在成熟淋巴組織增殖性疾病中檢測微小疾病殘留 180
第15章采用QuantStudioTM 3D數(shù)字PCR系統(tǒng)對JAK2 V617F等位基因負荷進行定量 204
第16章采用數(shù)字PCR對稀有等位基因進行定量的新型多重策略 218
第17章鑒別和使用個體化的基因組標志物進行循環(huán)腫瘤DNA的監(jiān)測 239
第18章單色多重微滴數(shù)字PCR拷貝數(shù)檢測和單核苷酸變異分型 255
第19章一種用一組預(yù)選的SNP監(jiān)測移植后健康的通用微滴數(shù)字PCR方法 264
第20章采用微滴數(shù)字PCR對內(nèi)源性基因座的基因組編輯所導(dǎo)致的HDR和NHEJ進行檢測和定量 276
第21章采用微滴數(shù)字PCR進行DNA甲基化分析 288
第Ⅴ部分基因表達和RNA定量
第22章采用微滴數(shù)字PCR進行多個選擇性剪切mRNA轉(zhuǎn)錄本的同時定量 307
第23章采用微滴數(shù)字PCR分析等位基因特異RNA的表達 318
第24章采用五重微滴數(shù)字PCRTM方法對極低豐度的單細胞轉(zhuǎn)錄本進行定量 335
第25章采用微滴數(shù)字PCR對循環(huán)MicroRNA進行定量 352
第26章采用微滴數(shù)字PCR對血漿和血清中的細胞外MicroRNA進行絕對定量：癌癥生物標志物hsa-miR-141的定量 363
第Ⅵ部分分隔的其他用途
第27章微滴數(shù)字PCR用于二代測序文庫的質(zhì)控檢測 379
第28章使用數(shù)字PCR定相DNA標志物 389
第29章 ddTRAP：一種敏感且準確定量端粒酶活性的方法 407
第30章采用微滴數(shù)字PCR的分隔功能進行高效和可靠的DNA適配體分選：Hi-Fi SELEX方法 421