Olex2軟件單晶結(jié)構(gòu)解析及晶體可視化

第1章 Olex2軟件的介紹、配置、優(yōu)缺點(diǎn)及引用 1
1.1 Olex2軟件的介紹 2
1.2 Olex2的配置 2
1.3 Olex2的圖形化界面及各個(gè)選項(xiàng)卡和按鈕的作用 3
1.4 Olex2基本操作 13
1.5 Olex2的優(yōu)缺點(diǎn) 15
1.6 Olex2的引用 16
1.7 Olex2 的更新 16

第2章 單晶衍射點(diǎn)數(shù)據(jù)APEX3與CrysAlisPro還原流程 17
2.1 APEX3數(shù)據(jù)還原過程 18
2.2 CrysAlispro數(shù)據(jù)還原過程 28

第3章 Olex2軟件單晶結(jié)構(gòu)解析整體流程 43
3.1 建立文件夾，運(yùn)行XPREP程序 44
3.2 利用Solve進(jìn)行初解結(jié)構(gòu) 49
3.3 利用Refine進(jìn)行結(jié)構(gòu)精修 52
3.4 給原子進(jìn)行編號(hào)、排序 54
3.5 原子加氫 55
3.6 精修權(quán)重 57
3.7 解析的合理性 58
3.8 生成cif文件及檢測cif文件 59
3.9 產(chǎn)生結(jié)構(gòu)信息報(bào)告 61
3.10 總結(jié) 62

第4章 解析實(shí)例 63
4.1 利用Solve-ShelXS中的重原子法Patterson Method進(jìn)行解析 64
4.2 置換無序處理 79
4.3 手性晶體絕對構(gòu)型的確定與翻轉(zhuǎn) 91
4.4 孿晶及孿晶矩陣拆分 99
4.5 無序的處理及限制命令的應(yīng)用 108
4.6 晶體空間群變換及對稱性檢查 115

第5章 cif文件的詳細(xì)解析、檢測及CCDC號(hào)的申請 123
5.1 cif格式詳細(xì)講解 124
5.2 cif文件的檢測 133
5.3 cif檢測出現(xiàn)的A、B等類警告的講解 136
5.4 一些常見A類警告及解決辦法 140
5.5 CCDC號(hào)的申請 143
5.6 CCDC、ICSD的使用 149

第6章 晶體結(jié)構(gòu)畫圖 157
6.1 ShelXTL軟件畫圖 158
6.2 Diamond軟件畫圖 170
6.3 Mercury軟件畫圖 175

第7章 三維拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 177
7.1 [Ln(H2O)7][Ln(H2O)5][Co2Mo10H4O38]拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 178
7.2 (C2N2H10)2[Sr(H2O)5][Co2Mo10H4O38]·2H2O拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 186
7.3 (C2N2H10)2[Ba(H2O)3][Co2Mo10H4O38]·3H2O拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析 191

參考文獻(xiàn) 198