高通量測序技術(shù)在選擇性剪接研究中的應(yīng)用

前言
第1章 BioIDMapper：生物大分子編碼轉(zhuǎn)換系統(tǒng)
1．1 生物大分子編碼轉(zhuǎn)換
1．2 BioIDMapper下載資源
1．3 系統(tǒng)要求
1．4 軟件構(gòu)架
1．5 功能簡介
1．6 圖形用戶界面
1．7 實例
1．8 項目分析
1．9 用戶使用統(tǒng)計
1．10 結(jié)論
第2章 SplicingTypesAnno：選擇性剪接識別軟件
2．1 選擇性剪接軟件
2．2 SplicingTypesAnno下載資源
2．3 系統(tǒng)安裝
2．4 主要剪接類型
2．5 單個基因分析和全轉(zhuǎn)錄組分析
2．6 輸入輸出格式
2．7 功能描述
2．8 項目分析
2．9 總結(jié)報告
2．10 用戶使用統(tǒng)計
2．11 結(jié)論
第3章 nagnag：NAGNAG選擇性剪接識別及定量軟件
3．1 NAGNAG選擇性剪接進(jìn)展
3．2 nagnag下載資源
3．3 輸入輸出格式
3．4 功能描述
3．5 項目分析
3．6 用戶使用統(tǒng)計
3．7 結(jié)論
第4章 prettycloud：文本數(shù)據(jù)的可視化工具
4．1 文本數(shù)據(jù)的可視化
4．2 prettycloud下載資源
4．3 安裝
4．4 prettycloud算法
4．5 相關(guān)參數(shù)
4．6 實例
4．7 用戶使用統(tǒng)計
4．8 結(jié)論
第5章 pairheatmap：高通量數(shù)據(jù)可視化工具
5．1 熱圖
5．2 pairheatmap下載資源
5．3 相關(guān)參數(shù)
5．4 高通量測序數(shù)據(jù)分析
5．5 用戶使用統(tǒng)計
5．6 結(jié)論
第6章 基因芯片分析挖掘表達(dá)差異基因
6．1 基因芯片技術(shù)
6．2 數(shù)據(jù)分析流程
6．3 項目分析
6．4 結(jié)論
第7章 高通量測序RNA-seq數(shù)據(jù)分析挖掘
7．1 高通量測序
7．2 高通量測序分析流程
7．3 高通量轉(zhuǎn)錄組測序研究領(lǐng)域
第8章 NAGNAG選擇性剪接研究
8．1 NAGNAG選擇性剪接
8．2 研究方法
8．3 結(jié)果分析
8．4 結(jié)論
第9章 轉(zhuǎn)錄非編碼區(qū)的識別和分析挖掘
9．1 轉(zhuǎn)錄非編碼區(qū)研究進(jìn)展
9．2 材料與方法
9．3 結(jié)果與分析
9．4 結(jié)論
第10章 長鏈非編碼RNA的識別和定量
10．1 長鏈非編碼RNA
10．2 研究方法
10．3 項目分析
10．4 結(jié)論
第11章 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析
11．1 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
11．2 材料與方法
11．3 結(jié)果
11．4 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可視化
11．5 結(jié)論
第12章 環(huán)形RNA的識別和定量
12．1 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀及分析
12．2 研究方法
12．3 分析流程
12．4 項目分析
12．5 結(jié)論
主要參考文獻(xiàn)