蝶類線粒體基因組及分子系統(tǒng)發(fā)育研究

前言 第1章蝴蝶的分類研究 1.1國(guó)外蝶類分類研究 1.2國(guó)內(nèi)蝶類分類研究 參考文獻(xiàn) 第2章蝶類線粒體基因組 2.1蝶類昆蟲(chóng)線粒體基因組 2.2線粒體基因組的研究方法 2.2.1基于物理分離的方法 2.2.2基于常規(guī)PCR技術(shù)的方法 2.2.3基于LA—PCR技術(shù)的方法 2.2.4高通量測(cè)序技術(shù) 2.2.5線粒體基因組數(shù)據(jù)的分析方法 2.3蝶類線粒體基因組全序列測(cè)序進(jìn)展 2.4線粒體基因組在蝶類系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用 2.4.116SrDNA基因 2.4.2Cytb基因 2.4.3COI和COII基因 2.4.4ND1和ND5基因 2.4.5線粒體基因組全序列 參考文獻(xiàn) 第3章蝶類的分子系統(tǒng)學(xué)研究 3.1分子系統(tǒng)學(xué)的研究?jī)?nèi)容與方法 3.1.1蛋白質(zhì)水平標(biāo)記 3.1.2DNA分子標(biāo)記 3.1.3DNA序列分析 3.2系統(tǒng)發(fā)育的推斷方法—構(gòu)建分析系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 3.2.1系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 3.2.2常用的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 3.3蝶類分子系統(tǒng)學(xué)的研究進(jìn)展 參考文獻(xiàn) 第4章材料與方法 4.1材料 4.2方法 4.2.1DNA提取 4.2.2引物設(shè)計(jì) 4.2.3PCR擴(kuò)增 4.2.4序列的拼接和注釋 4.3序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建 4.3.1序列比對(duì) 4.3.2系統(tǒng)發(fā)育信號(hào)檢測(cè) 4.3.3系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建 參考文獻(xiàn) 第5章10種蝴蝶的線粒體基因組分析 5.1玉斑鳳蝶線粒體基因組 5.1.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.1.2基因間隔與重疊 5.1.3堿基組成特征 5.1.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.1.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.1.6A+T富含區(qū) 5.2玉帶鳳蝶線粒體基因組 5.2.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.2.2基因間隔與重疊 5.2.3堿基組成特征 5.2.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.2.5核糖體RNA及轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.2.6A+T富含區(qū) 5.3碧鳳蝶線粒體基因組 5.3.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.3.2基因間隔與重疊 5.3.3堿基組成特征 5.3.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.3.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.3.6A+T富含區(qū) 5.4金斑喙鳳蝶（廣西亞種）線粒體基因組 5.4.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.4.2基因間隔與重疊 5.4.3堿基組成特征 5.4.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.4.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.4.6A+T富含區(qū) 5.5燕風(fēng)蝶線粒體基因組 5.5.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與特征 5.5.2基因間隔與重疊 5.5.3堿基組成特征 5.5.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.5.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.5.6A+T富含區(qū) 5.6箭環(huán)蝶線粒體基因組 5.6.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與特征 5.6.2基因間隔與重疊 5.6.3堿基組成特征 5.6.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.6.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.6.6A+T富含區(qū) 5.7藍(lán)點(diǎn)紫斑蝶線粒體基因組 5.7.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.7.2基因間隔與重疊 5.7.3堿基組成特征 5.7.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.7.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.7.6A+T富含區(qū) 5.8枯葉蛺蝶線粒體基因組 5.8.1線粒體全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.8.2基因間隔與重疊 5.8.3堿基組成特征 5.8.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.8.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.8.6A+T富含區(qū) 5.9黃斑弄蝶線粒體基因組 5.9.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.9.2基因間隔與重疊 5.9.3堿基組成特征 5.9.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.9.5核糖體RNA及轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.9.6A+T富含區(qū) 5.10青斑蝶線粒體基因組 5.10.1線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)與組成 5.10.2基因間隔與重疊 5.10.3堿基組成與特征 5.10.4蛋白質(zhì)編碼基因 5.10.5核糖體RNA和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 5.10.6A+T富含區(qū) 參考文獻(xiàn) 第6章基于16SrRNA和16SrRNA+Wingless基因聯(lián)合序列蝶類的系統(tǒng)發(fā)育 6.1材料與方法 6.1.1材料 6.1.2系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建 6.2結(jié)果與分析 6.2.1基于16SrRNA序列構(gòu)建的NJ、MP和BI系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 6.2.2基于16SrRNA+Wingless基因聯(lián)合序列構(gòu)建的 NJ、MP和BI系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 6.3討論 6.3.1總科級(jí)分類單元的系統(tǒng)關(guān)系 6.3.2科級(jí)分類單元的系統(tǒng)關(guān)系 6.3.3不同數(shù)據(jù)集和構(gòu)樹(shù)方法間的差異 6.3.4外群的選擇 參考文獻(xiàn) 第7章基于線粒體基因組全序列鱗翅目的系統(tǒng)發(fā)育分析 7.1材料與方法 7.1.1物種選取 7.1.2系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建 7.2結(jié)果與分析 7.3討論 7.3.1總科級(jí)分類單元的系統(tǒng)關(guān)系 7.3.2科級(jí)分類單元的系統(tǒng)關(guān)系 參考文獻(xiàn) …… 第8章基于線粒體基因組全序列與核基因EF—1a序列的蝶類系統(tǒng)發(fā)育分析 第9章基于線粒體基因組全序列與無(wú)翅基因（Winglees）序列蝶類的系統(tǒng)發(fā)育分析