桿狀病毒分子生物學(xué)（第三版）

第一章 桿狀病毒簡介、分類和進(jìn)化
一、桿狀病毒的發(fā)現(xiàn)歷程
二、定義不在名字中：命名桿狀病毒
三、用什么定義桿狀病毒？
四、桿狀病毒的多樣性
五、相關(guān)病毒
參考文獻(xiàn)
第二章 桿狀病毒包涵體和病毒粒子的結(jié)構(gòu)蛋白
一、包涵體的進(jìn)化
二、包涵體蛋白
三、多角體相關(guān)蛋白
四、桿狀病毒的病毒粒子：囊膜蛋白
五、核衣殼的結(jié)構(gòu)
六、所有桿狀病毒均編碼的BV和ODV核衣殼相關(guān)蛋白
七、宿主蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)修飾
參考文獻(xiàn)
第三章 桿狀病毒復(fù)制周期：對細(xì)胞和昆蟲的影響
一、昆蟲的中腸
二、兩種類型的病毒粒子
三、從包涵體到易感的中腸細(xì)胞
四、進(jìn)入細(xì)胞核
五、從細(xì)胞出芽形成BV
六、引發(fā)全身感染的病毒
七、參與感染周期的病毒蛋白
八、出芽型病毒與細(xì)胞內(nèi)病毒，它們是否存在轉(zhuǎn)變？
九、包埋，病毒感染的最終階段
十、病毒的擴(kuò)散
十一、GV的病理學(xué)
十二、僅限于中腸感染的病毒：膜翅目和雙翅目昆蟲的NPV
十三、持續(xù)的、潛在的、隱蔽的桿狀病毒感染
參考文獻(xiàn)
第四章 病毒感染的早期事件：病毒轉(zhuǎn)錄
一、轉(zhuǎn)錄活化子、增強(qiáng)子和宿主RNA聚合酶
二、桿狀病毒的感染：對宿主細(xì)胞基因表達(dá)的選擇性影響
三、桿狀病毒的轉(zhuǎn)錄級聯(lián)反應(yīng)：一種新策略的進(jìn)化
四、轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子
五、桿狀病毒的增強(qiáng)子：同源重復(fù)序列(hrs)
六、早期基因的一個主要轉(zhuǎn)錄活化因子，即刻早期基因1(IE-1，Acl47)
七、IE-1結(jié)合到hr序列
八、調(diào)控早期病毒基因轉(zhuǎn)錄的RNA聚合酶Ⅱ信號
九、桿狀病毒的全基因組分析
十、早期基因的有序表達(dá)
十一、其他說明和限制條件
參考文獻(xiàn)
第五章 病毒DNA復(fù)制和基因組加工
一、病毒DNA復(fù)制起始位點(diǎn)的鑒定
二、DNA合成的必需基因
三、影響DNA復(fù)制的其他基因
四、桿狀病毒的DNA復(fù)制基因：缺少了什么？
五、桿狀病毒DNA復(fù)制的位置：病毒發(fā)生基質(zhì)的形成
六、其他的桿狀病毒基因：DNA修復(fù)的提示
七、參與核苷酸生化合成的基因
八、桿狀病毒的基因組是如何被復(fù)制的？
九、基于重組的復(fù)制的影響：多個復(fù)制起點(diǎn)，共價封閉的環(huán)狀基因組，以及每個囊膜中含有多個核衣殼
十、基因組DNA的加工和包裝
十一、更多尚未回答的問題
參考文獻(xiàn)
第六章 桿狀病毒的晚期轉(zhuǎn)錄
一、桿狀病毒晚期基因的活化
二、桿狀病毒的晚期啟動子元件
三、昆蟲病毒的RNA聚合酶和包涵體蛋白的超表達(dá)
四、桿狀病毒的RNA聚合酶
五、RNA聚合酶的類別
六、桿狀病毒RNA聚合酶與其他RNA聚合酶的關(guān)系
七、體外轉(zhuǎn)錄實驗
八、早期和晚期mRNA的終止和聚腺苷化
九、極晚期基因的表達(dá)
十、其他參與晚期轉(zhuǎn)錄的基因
參考文獻(xiàn)
第七章 桿狀病毒感染：細(xì)胞周期與凋亡
一、桿狀病毒感染和細(xì)胞周期
二、病毒合成途徑：一個“偽”S期或“病毒”S期環(huán)境的誘導(dǎo)
三、細(xì)胞凋亡和桿狀病毒感染
四、AcMNPV的orf92(p33)，細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期之間的關(guān)聯(lián)？
參考文獻(xiàn)
第八章 宿主抗性、易感性以及病毒感染對宿主分子生物學(xué)的影響
一、昆蟲免疫系統(tǒng)：血細(xì)胞、黑化反應(yīng)和包囊作用
二、宿主細(xì)胞對桿狀病毒感染的反應(yīng)：來自蛋白質(zhì)組學(xué)、芯片及表達(dá)分析的證據(jù)
三、調(diào)節(jié)病毒感染的其他途徑
四、宿主中腸對桿狀病毒感染的抗性
五、影響桿狀病毒宿主范圍的其他因素
六、BmNPV和AcMNPV在家蠶和草地貪夜蛾細(xì)胞中宿主范圍的調(diào)查
七、全體蛋白質(zhì)(global protein)合成關(guān)閉
八、細(xì)胞凋亡和桿狀病毒感染的特異性
參考文獻(xiàn)
第九章 桿狀病毒作為殺蟲劑
一、感染梨豆毛蟲(Anticarsia gemmatalis)的一種NPV：在巴西的應(yīng)用——一個大挫折．
二、感染蘋果蠹蛾(Cydia pomonella)的一種顆粒體病毒：在北美和歐洲的應(yīng)用
三、感染棉鈴蟲(Helicoverpa armigera)的一種NPV：在中國的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第十章 桿狀病毒表達(dá)技術(shù)：原理與應(yīng)用
一、一些歷史
二、啟動感染：環(huán)境的穩(wěn)定性和昆蟲中腸
三、雙相復(fù)制周期的進(jìn)化允許(病毒)開發(fā)利用昆蟲系統(tǒng)的生物合成能力
四、優(yōu)化細(xì)胞內(nèi)環(huán)境：病毒的RNA聚合酶以及感染晚期大部分病毒和宿主基因的關(guān)閉
五、極晚期基因(p10和多角體蛋白基因)的激活和轉(zhuǎn)錄
六、基因拷貝數(shù)和未包進(jìn)衣殼的病毒DNA的作用
七、桿狀病毒基因表達(dá)和生物技術(shù)
八、總結(jié)和結(jié)論
九、桿狀病毒表達(dá)技術(shù)的應(yīng)用
十、桿狀病毒表達(dá)蛋白質(zhì)的翻譯后加工
參考文獻(xiàn)
第十一章 桿狀病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、DNA轉(zhuǎn)座子(piggyBac)和昆蟲細(xì)胞
一、與桿狀病毒相關(guān)的游移病毒(逆轉(zhuǎn)錄病毒)
二、鱗翅目昆蟲中的游移病毒
三、昆蟲逆轉(zhuǎn)錄病毒和桿狀病毒之間的聯(lián)系：env基因
四、桿狀病毒的F蛋白／(游移病毒的env蛋白)的細(xì)胞內(nèi)同源物
五、桿狀病毒的F蛋白和昆蟲逆轉(zhuǎn)錄病毒的env蛋白的特點(diǎn)
六、昆蟲逆轉(zhuǎn)錄病毒和桿狀病毒的其他關(guān)系
七、游移病毒具有感染性嗎？
八、env是否在游移病毒傳染中發(fā)揮作用？
九、逆轉(zhuǎn)錄因子的入侵和擴(kuò)增
十、是什么阻止逆轉(zhuǎn)錄因子不斷擴(kuò)增？
十一、DNA和組蛋白甲基化對轉(zhuǎn)座元件的抑制
十二、通過RNA干擾抑制轉(zhuǎn)座元件
十三、Argonautes蛋白：具有RNA酶活性的蛋白質(zhì)，并且對RNA干擾非常重要
十四、性腺細(xì)胞中轉(zhuǎn)座元件的抑制
十五、在果蠅中，flamenco是piRNA的一種來源
十六、桿狀病毒感染過程中內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄因子序列的激活
十七、piggyBac，來自粉紋夜蛾(Trichoplusia ni)的轉(zhuǎn)座子，最初從桿狀病毒分離而來
參考文獻(xiàn)
第十二章 AcMNPV基因組：基因含量、保守性和功能
一、AcMNPV基因組數(shù)據(jù)的調(diào)整：大約存在150個開放閱讀框
二、AcMNPV基因組注釋
參考文獻(xiàn)
第十三章 與AcMNPV基因組不同源的部分桿狀病毒基因：保守性和功能
參考文獻(xiàn)
第十四章 專業(yè)詞匯
參考文獻(xiàn)
第十五章 附錄
附錄1 NcBI數(shù)據(jù)庫中已測序的桿狀病毒基因組列表
附錄2 基因組已被測序桿狀病毒的昆蟲宿主名稱