R與ASReml-R統(tǒng)計分析教程

第1章 R語言簡介
1.1 R語言
1.2 R的特點
1.3 R的資源
1.4 R的安裝與運行
1.4.1 R軟件的安裝、啟動與關閉
1.4.2 R程序包的安裝與使用
1.5 Rstudio的安裝與運行
第2章 數據集創(chuàng)建
2.1 數據的創(chuàng)建
2.1.1 向量的建立
2.1.2 數組的建立
2.1.3 矩陣的建立
2.1.4 數據框的建立
2.1.5 列表的建立
2.1.6 因子的建立
2.1.7 對象的模式和屬性
2.2 數據的輸入
2.2.1 鍵盤輸入
2.2.2 使用scan（）函數
2.2.3 導入csv文件
2.2.4 導入Excel數據
2.2.5 導入SAS數據
2.2.6 導入SPSS數據
2.2.7 其他方式導入
2.3 數據的存儲
第3章 數據操作
3.1 變量的創(chuàng)建與刪除
3.2 變量的重命名
3.3 缺失值的處理
3.4 數據類型的轉換
3.5 數據的排序
3.6 數據集的合并
3.6.1 列合并
3.6.2 行合并
3.7 數據子集的提取
3.7.1 根據位置選取子集
3.7.2 根據列名選取子集
3.7.3 使用subset（）函數
3.8 數據的整合與重構
3.8.1 數據轉置
3.8.2 數據整合
3.8.3 使用reshape2包
3.9 處理數據常用的函數
3.10數據探索
3.10.1 數據結構查看
3.10.2 查看單個變量
3.10.3 查看多個變量
3.10.4 其他查看方法
3.10.5 保存統(tǒng)計圖形
3.11循環(huán)控制和條件操作
3.11.1 條件語句
3.11.2 循環(huán)語句
3.12自編函數
第4章 常用統(tǒng)計分析
4.1 描述性統(tǒng)計分析
4.1.1 使用summaryr（）函數
4.1.2 使用stat.desc（）函數
4.1.3 使用describe（）函數
4.2 頻數表分析
4.3 方差分析
4.3.1 單因素方差分析
4.3.2 無重復試驗的雙因素方差分析
4.3.3 等重復試驗的雙因素方差分析
4.3.4 多元方差分析
4.4 協(xié)方差分析
4.5 顯著性檢驗——t檢驗
4.5.1 單樣本檢驗
4.5.2 獨立的雙樣本t檢驗
4.5.3 非獨立的雙樣本t檢驗
4.6 x2檢驗
4.6.1 適合性檢驗
4.6.2 獨立性檢驗
4.7 線性回歸
4.7.1 簡單線性回歸
4.7.2 多項式回歸
4.7.3 多元線性回歸
4.7.4 有交互項的多元線性回歸
4.7.5 回歸診斷
4.7.6 異常值判斷
4.7.7 回歸模型的改進措施
4.7.8 最佳回歸模型的選擇
4.7.9 廣義線性模型
4.8 相關分析
4.8.1 相關的類型
4.8.2 相關顯著性的檢驗
4.8.3 相關關系的可視化
4.9 常用試驗設計與數據分析
4.9.1 完全隨機設計
4.9.2 隨機區(qū)組設計
4.9.3 拉丁方設計
4.9.4 平衡不完全區(qū)組設計
4.9.5 正交試驗設計
4.9.6 裂區(qū)設計
4.9.7 巢式設計
4.9.8 全因子設計
4.10功效分析
4.10.1 功效分析
4.10.2 繪制功效分析圖
4.11主成分和因子分析
4.11.1 主成分分析
4.11.2 因子分析
4.12聚類分析
4.12.1 系統(tǒng)聚類法
4.12.2 動態(tài)聚類法
第5章 統(tǒng)計圖形繪制
5.1 基礎繪圖
5.1.1 條形圖
5.1.2 餅圖
5.1.3 直方圖
5.1.4 核密度圖
5.1.5 散點圖
5.1.6 熱圖
5.1.7 等高圖
5.1.8 三維透視圖
5.1.9 小提琴圖
5.1.10顏色等高圖
5.1.11散點圖矩陣
5.1.12條件圖
5.1.13相關圖
5.1.14地圖
5.2 高級繪圖
5.2.1 lattice包
5.2.2 ggplot2包
5.3 基礎繪圖常用參數
5.3.1 顏色
5.3.2 符號和線條
5.3.3 標題
5.3.4 圖例
5.3.5 坐標軸
5.3.6 多圖組合
第6章 ASReml-R包與遺傳參數估算
6.1 ASReml程序包的介紹
6.2 ASReml-R的基本語法
6.2.1 單性狀分析
6.2.2 雙性狀分析
6.3 林業(yè)試驗常用模型
6.4 遺傳參數估算
6.4.1 半同胞子代測定
6.4.2 全同胞子代測定
6.4.3 無性系測定
6.4.4 空間分析
6.4.5 多地點試驗——G×E分析
6.4.6 遺傳相關分析
6.5 綜合案例分析
常用網址
參考文獻
索引
程序包名單