軟物質(zhì)的計算機模擬與理論方法

1 高分子鏈聚合初生態(tài)的結(jié)晶
1.1 高分子鏈的“初生態(tài)”
1.2 鏈生長分子動力學(xué)方法
1.3 GCMD方法的驗證
1.4 聚乙烯單鏈初生態(tài)結(jié)構(gòu)的研究
1.4.1 單鏈在表面上生長過程的兩個階段
1.4.2 晶干在伸長過程中的協(xié)同運動
1.4.3 初生態(tài)單分子鏈的折疊機理
1.5 聚乙烯多鏈體系初生態(tài)結(jié)構(gòu)的研究
1.5.1 不同活性點密度的體系的形貌發(fā)展
1.5.2 不同活性點密度的體系的結(jié)構(gòu)分析
1.6 總結(jié)
參考文獻
2 高分子鏈的穿插與結(jié)晶
2.1 非平衡態(tài)高分子鏈的纏結(jié)問題和鏈纏結(jié)的結(jié)構(gòu)屬性
2.2 高分子鏈的穿插程度
2.3 表面與本體的穿插程度
2.4 纏結(jié)對結(jié)晶的影響
2.5 位點序參數(shù)
2.5.1 位點序參數(shù)方法
2.5.2 臨界成核位點序參數(shù)值
2.6 穿插程度與結(jié)晶的關(guān)系
2.6.1 整體穿插程度與結(jié)晶速率
2.6.2 局部穿插程度與成核的分布
2.6.3 局部成核與生長過程
2.7 總結(jié)
附錄一 建模與模擬細(xì)節(jié)
附錄二 ICF與SOP的算法探討
參考文獻
3 聚合物的粗?；Ｐ?br />3.1 介紹
3.2 普適的粗粒化模型
3.2.1 粒子基粗?；Ｐ?br />3.2.2 場基粗?；Ｐ?br />3.3 系統(tǒng)的粗?；Ｐ?br />3.4 應(yīng)用實例
3.5 總結(jié)與展望
參考文獻
4 團簇結(jié)構(gòu)優(yōu)化算法與應(yīng)用
4.1 引言
4.2 無偏優(yōu)化算法用于團簇的結(jié)構(gòu)優(yōu)化
4.2.1 遺傳算法
4.2.2 快速退火演化算法
4.2.3 隨機隧道算法
4.3 基于格點搜索的團簇優(yōu)化方法
4.3.1 格點的建立
4.3.2 格點搜索
4.3.3 應(yīng)用舉例
4.4 動態(tài)格點搜索算法
4.4.1 動態(tài)格點
4.4.2 動態(tài)格點搜索算法
4.4.3 動態(tài)格點搜索算法的改進
4.4.4 應(yīng)用舉例
參考文獻
5 雜化蒙特卡羅和廣義系綜模擬方法
5.1 背景簡介
5.2 雜化蒙特卡羅方法
5.2.1 針對問題及特點
5.2.2 算法實現(xiàn)
5.2.3 應(yīng)用實例和注意事項
5.2.4 雜化蒙特卡羅方法優(yōu)缺點
5.3 廣義系綜模擬方法
5.3.1 針對問題及特點
5.3.2 并行回火方法
5.3.3 多正則系綜方法
5.4 總結(jié)
參考文獻
6 構(gòu)象態(tài)躍遷行為與玻璃化轉(zhuǎn)變
6.1 聚合物構(gòu)象能
6.1.1 單鍵的構(gòu)象能
6.1.2 一對鍵的構(gòu)象能
6.2 聚合物本體的模擬
6.3 聚合物本體性質(zhì)
6.3.1 聚合物玻璃化轉(zhuǎn)變溫度及分子鏈結(jié)構(gòu)
6.4 構(gòu)象分布與表觀構(gòu)象能_
6.4.1 聚合物鏈的松弛行為
6.5 玻璃化轉(zhuǎn)變前后構(gòu)象躍遷行為的變化
6.5.1 構(gòu)象躍遷
6.5.2 躍遷速率和活化能在玻璃化轉(zhuǎn)變溫度附近的變化
6.5.3 玻璃態(tài)聚合物構(gòu)象躍遷的非均質(zhì)現(xiàn)象
6.5.4 躍遷的起始角和旋轉(zhuǎn)角
6.5.5 構(gòu)象“凍結(jié)”比例
6.5.6 玻璃化轉(zhuǎn)變過程中構(gòu)象熵的變化
參考文獻
7 表面活性劑與泡沫的穩(wěn)定性
7.1 表面活性劑在氣液界面的動態(tài)行為
7.1.1 模擬參數(shù)及過程
7.1.2 純水氣液界面的模擬結(jié)果
7.1.3 表面活性劑在氣液界面的動態(tài)行為以及性質(zhì)
7.2 模擬研究表面活性劑對泡沫的穩(wěn)定性
7.2.1 模擬模型
7.2.2 臨界膜厚的定義及尺度對結(jié)果的影響
7.2.3 穩(wěn)定指數(shù)
7.2.4 表面活性劑的效率與泡沫的穩(wěn)定性
參考文獻
8 分子力學(xué)力場及參數(shù)化方法
8.1 引言
8.2 基本原理
8.2.1 鍵伸縮項
8.2.2 鍵角彎曲項
8.2.3 二面角扭轉(zhuǎn)項
8.2.4 偏離平面振動項
8.2.5 非正常二面角扭轉(zhuǎn)項
8.2.6 范德華相互作用項
8.2.7 庫侖作用項
8.3 經(jīng)驗參數(shù)化方法
8.3.1 MM3系列力場
8.3.2 AMBER力場
8.3.3 CHARMM力場
8.4 基于量子化學(xué)計算的參數(shù)化方法
8.4.1 CFF力場
8.4.2 MMFF系列力場
8.4.3 Direct Force Field
8.5 成功應(yīng)用于凝聚相的關(guān)鍵問題
8.5.1 OPLS力場
8.5.2 COMPASS力場
8.5.3 TraPPE力場
8.6 普適的經(jīng)驗力場
8.6.1 Dreiding力場
8.6.2 覆蓋全周期表元素的UFF力場
8.7 極化力場
8.8 反應(yīng)力場
參考文獻
9 耗散粒子動力學(xué)的原理與應(yīng)用
9.1 耗散粒子動力學(xué)簡介
……
10 模擬表面活性劑體系的介觀力場方法
11 自洽平均場理論方法
參考文獻