常用生物數(shù)據(jù)分析軟件

序
前言
第1章 Unix/Linux操作系統(tǒng)介紹
1.1 遠(yuǎn)程登錄
1.2 文件的復(fù)制、刪除和移動命令
1.3 目錄的創(chuàng)建、刪除及更改目錄命令
1.4 文本查看命令
1.5 文本處理命令
1.6 改變文件或目錄的權(quán)限命令
1.7 備份與壓縮命令
1.8 磁盤及系統(tǒng)管理
1.9 軟件安裝簡介
1.10 其他
第2章 數(shù)據(jù)的基本處理
2.1 數(shù)據(jù)常用格式介紹
2.2 測序原理介紹
2.3 華圖轉(zhuǎn)化（Phred）
2.4 文件轉(zhuǎn)換（phd2fasta）
2.5 載體屏蔽（cross_match）
2.6 序列聚類拼接
2.7 Consed
2.8 引物設(shè)計（Primer3）
主要參考文獻(xiàn)
第3章 序列的比對
3.1 全局比對
3.2 局部比對
主要參考文獻(xiàn)
第4章 基因組/基因的注釋
4.1 重復(fù)序列分析
4.2 RNA分析
4.3 基因預(yù)測
4.4 基因功能注釋
主要參考文獻(xiàn)
第5章 SNP分析
5.1 Polyphred
5.2 SNPdetector
5.3 cross_match
主要參考文獻(xiàn)
第6章 進(jìn)化分析專題
6.1 Phylip
6.2 Paml
6.3 KaKs_Calculator
6.4 FGF
6.5 MEGA
主要參考文獻(xiàn)
第7章 基因表達(dá)分析專題
7.1 EST表達(dá)序列標(biāo)簽分析
7.2 生物芯片分析
7.3 Motif預(yù)測
主要參考文獻(xiàn)
第8章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)知識介紹
8.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法
8.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的Threading方法
8.4 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測流程介紹
主要參考文獻(xiàn)