疾病蛋白質(zhì)組學

第一章 緒論
第一節(jié) 蛋白質(zhì)組學的概念及其發(fā)展史
一、蛋白質(zhì)組學的概念
二、蛋白質(zhì)組學的產(chǎn)生與發(fā)展
第二節(jié) 蛋白質(zhì)組學研究方法概述
一、蛋白質(zhì)組研究中的樣品制備
二、蛋白質(zhì)組研究中的樣品分離
三、蛋白質(zhì)組研究中的樣品分析鑒定
四、蛋白質(zhì)組研究的新技術
五、蛋白質(zhì)組學研究的生物信息學
第三節(jié) 蛋白質(zhì)組學在疾病研究中的應用
參考文獻
第二章 蛋白質(zhì)樣品制備技術
第一節(jié) 蛋白質(zhì)制備的基本方法
一、細胞的破碎裂解
二、制備蛋白質(zhì)樣品常用的緩沖液
三、離液劑、還原劑、表面活性劑及蛋白酶抑制劑的選擇
四、蛋白質(zhì)的沉淀與濃縮
五、蛋白質(zhì)的定量
六、樣品污染物的去除
第二節(jié) 細胞蛋白質(zhì)的制備
一、蛋白質(zhì)一步提取法
二、蛋白質(zhì)分步順序提取法
三、亞細胞器蛋白質(zhì)的分別提取
第三節(jié) 體液蛋白質(zhì)的制備
一、血漿和血清雙向凝膠電泳蛋白質(zhì)樣品的制備
二、腦脊液雙向凝膠電泳蛋白質(zhì)樣品的制備
三、尿液雙向凝膠電泳蛋白質(zhì)樣品的制備
參考文獻
第三章 蛋白質(zhì)雙向凝膠電泳分離技術
第一節(jié) 雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳技術的發(fā)展
一、固相pH梯度等電聚焦雙向電泳技術的發(fā)展
二、其他類型的雙向凝膠電泳技術
三、亞蛋白質(zhì)組陣列重疊群技術
第二節(jié) 蛋白質(zhì)雙向凝膠電泳分析的原理
第三節(jié) 雙向凝膠電泳實驗操作方法
一、傳統(tǒng)IEF方法（ISO?DALT電泳）
二、固相pH梯度?SDS雙向凝膠電泳（IPG?DALT）方法
第四節(jié) 雙向凝膠電泳圖像分析
一、雙向凝膠電泳數(shù)字化圖像的獲取
二、雙向凝膠電泳圖像分析
第五節(jié) 雙向凝膠電泳數(shù)據(jù)庫的構建
參考文獻
第四章 蛋白質(zhì)組學研究中的非膠技術
第一節(jié) 液相色譜法
一、液相色譜法概述
二、高效液相色譜法
三、高效液相色譜裝置
四、多維液相色譜法
第二節(jié) 毛細管電泳
一、毛細管區(qū)帶電泳
二、毛細管膠束電動色譜
三、毛細管等電聚焦電泳
四、毛細管篩分電泳
第三節(jié) 非凝膠技術與質(zhì)譜聯(lián)用在蛋白質(zhì)組學研究中的應用
一、二維離線式制備型高效液相色譜
二、一維液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用
三、多維液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用
四、液相色譜?毛細管電泳與質(zhì)譜聯(lián)用
參考文獻
第五章 質(zhì)譜技術與蛋白質(zhì)鑒定
第一節(jié) 蛋白質(zhì)鑒定技術概述
一、質(zhì)譜技術
二、質(zhì)譜技術鑒定蛋白質(zhì)策略
第二節(jié) 基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜技術
一、基質(zhì)輔助激光解析電離技術
二、飛行時間質(zhì)譜
三、肽質(zhì)量指紋譜鑒定蛋白質(zhì)技術
第三節(jié) 電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜技術
一、電噴霧電離質(zhì)譜的原理和特點
二、電噴霧質(zhì)譜法測定蛋白質(zhì)和多肽分子量
三、電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜法分析多肽和蛋白質(zhì)的一級結構
四、電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫檢索法鑒定蛋白質(zhì)
第四節(jié) 表面增強激光解析離子化?飛行時間質(zhì)譜技術
一、表面增強激光解析離子化?飛行時間質(zhì)譜蛋白質(zhì)芯片系統(tǒng)組成及原理
二、表面增強激光解析離子化?飛行時間質(zhì)譜分析步驟
三、表面增強激光解析離子化?飛行時間質(zhì)譜的應用
參考文獻
第六章 定量蛋白質(zhì)組學研究技術
第一節(jié) 基于雙向凝膠電泳的定量蛋白質(zhì)組研究策略
一、熒光差示雙向電泳的實驗原理
二、熒光差示雙向電泳實例及實驗過程
三、注意事項及存在的問題
第二節(jié) 基于生物質(zhì)譜的定量蛋白質(zhì)組研究策略
一、體內(nèi)標記
二、體外標記
三、需要注意的問題
參考文獻
第七章 蛋白質(zhì)組翻譯后修飾分析策略
第一節(jié) 概述
第二節(jié) 磷酸化蛋白質(zhì)組研究
一、概況
二、磷酸化蛋白質(zhì)的檢測方法
三、磷酸化蛋白質(zhì)或多肽的分離和富集
四、磷酸化肽段的質(zhì)譜檢測
五、磷酸化位點的質(zhì)譜分析
六、磷酸化蛋白質(zhì)組的定量分析
七、蛋白質(zhì)磷酸化的動力學研究
第三節(jié) 糖基化蛋白質(zhì)組研究
一、概況
二、糖基化蛋白的結構與類型
三、蛋白質(zhì)糖基化總體分析流程
四、糖基化蛋白質(zhì)的分離技術
五、生物質(zhì)譜技術解析蛋白質(zhì)糖基化
六、各類型糖基化蛋白質(zhì)組分析策略
參考文獻
第八章 功能蛋白質(zhì)組學研究技術
第一節(jié) 蛋白質(zhì)相互作用研究技術
一、酵母雙雜交系統(tǒng)
二、噬菌體表面顯示技術
三、基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)相互作用研究方法
第二節(jié) 蛋白質(zhì)芯片技術
一、蛋白質(zhì)芯片種類
二、蛋白質(zhì)芯片探針的制備
三、蛋白質(zhì)芯片的檢測
四、蛋白質(zhì)芯片技術的應用
第三節(jié) 磷酸化蛋白質(zhì)組分析技術在信號傳導研究中的應用
一、基于凝膠電泳的磷酸化蛋白質(zhì)組分析技術
二、非凝膠電泳的磷酸化蛋白質(zhì)組分析技術
參考文獻
第九章 蛋白質(zhì)組研究中的生物信息學
……
第十章 臨床蛋白質(zhì)組學研究
第十一章 實體腫瘤的蛋白質(zhì)組學研究
第十二章 血液系統(tǒng)疾病的蛋白質(zhì)組研究
第十四章 心血管疾病蛋白組學
第十五章 傳染病的蛋白質(zhì)組學研究
第十六章 衰老蛋白質(zhì)組學研究
附錄SWISS?PROT中DPAGE數(shù)據(jù)庫