基因表達(dá)序列標(biāo)簽（EST）數(shù)據(jù)分析手冊

目 錄
第 1 章 表達(dá)序列標(biāo)簽 (EST) 及其應(yīng)用

1.1 簡介
1.2 EST 的應(yīng)用
1.3 EST 測序分析流程
1.4 參考文獻(xiàn)
第 2 章 EST 數(shù)據(jù)分析平臺的構(gòu)建
2.1 簡介
2.2 硬件設(shè)備
2.3 Unix/Linux 操作系統(tǒng)及其常用命令
2.4 常用 EST 數(shù)據(jù)分析軟件的安裝
2.5 參考文獻(xiàn)
第 3 章 EST 信息檢索及常用數(shù)據(jù)庫
3.1 簡介
3.2 中文 文獻(xiàn)檢索
3.3 外文文獻(xiàn)檢索
3.4 文獻(xiàn)管理
3.5 EST 數(shù)據(jù)庫
3.6 參考文獻(xiàn)
第 4 章 EST 聚類，常見問題及解決方法
4.1 簡介
4.2 EST 序列聚類方法
4.3 EST 聚類中常見的問題及解決方法
4.4 參考文獻(xiàn)
第 5 章 EST 數(shù)據(jù)注釋及多序列聯(lián)配
5.1 簡介
5.2 序列比對（ BLAST ）
5.3 Interpro
5.4 多序列比對（ Clustal W ）
5.5 參考文獻(xiàn)
第 6 章 EST 功能分類與代謝途徑分析
6.1 簡介
6.2 EST 功能分類
6.3 EST 代謝途徑分析
6.4 EST 對應(yīng)基因產(chǎn)物系統(tǒng)分析
6.5 參考文獻(xiàn)
第 7 章 基因核苷酸序列分析
7.1 簡介
7.2 基因開放閱讀框的識別
7.3 內(nèi)含子 / 外顯子剪切位點識別
7.4 基因調(diào)控區(qū)域分析
7.5 密碼子使用偏性分析
7.6 限制性核酸內(nèi)切酶位點分析
7.7 核苷酸序列綜合分析軟件
7.8 參考文獻(xiàn)
第 8 章 基因蛋白質(zhì)序列分析
8.1 簡介
8.2 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
8.3 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.4 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域
8.5 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.6 分子系統(tǒng)發(fā)育分析
8.7 參考文獻(xiàn)