河姆渡遺址曾先后兩次進行過較大規(guī)模的發(fā)掘。1973年11月9日至1974年1月10日在1973年夏天試掘的基礎上,對遺址的南部進行了首次發(fā)掘,發(fā)現了四個疊壓的地層,揭露了干欄式建筑和水井等遺跡,土出了很具地域特色的夾炭黑陶器皿、骨耜等一批重要遺物,大量的動植物遺存,特別是栽培稻谷的大批量發(fā)現為同時期其他遺址所不見。所有這些重大發(fā)現,當年曾轟動國內外,得到學術界的普遍關注。1976年4月在杭州召開的“河姆渡遺址第一期考古發(fā)掘座談會”一,與會專家學者一致同意將河姆渡遺址第三、四層命名為“河姆渡文化”,并得到全國考古界的認同。這次發(fā)掘成果,由牟永抗、魏正瑾、吳玉賢、梅福根撰寫成《河姆渡遺址第一期發(fā)掘報告》發(fā)表于1978年第1期《考古學報》上。1977年10月8日至1978年1月28日,為一進一步了解河姆渡遺址內涵及干欄式建筑的布局、結構、規(guī)模等方面的內容,報請國家文物事業(yè)管理局批準,在距第一次發(fā)掘探方二十米的遺址北部進行了第二次發(fā)掘。此次發(fā)掘驗證了第一次發(fā)掘劃分的地層是正確的,發(fā)現了二十八個灰坑,以及干欄建筑基址等遺跡和二十七座墓葬、二座甕棺葬,出土了豐富的陶器、石、骨、角、牙器和木器等遺物,為進一步認識河姆渡遺址各遺址第二期發(fā)掘的主要收獲》為題發(fā)表于1980年第5期《文物》上。