蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)

第1章緒論
1.1引言.
1.2蛋白質(zhì)在生命過(guò)程中的作用
1.3蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的一般概念
1.4蛋白質(zhì)的基本組成單位
1.5多肽鏈
1.6多肽鏈的構(gòu)象
1.7蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)
第2章蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次
2.1蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位
2.2維持和穩(wěn)定蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的因素
2.3蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次
2.4小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第3章蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)和二級(jí)結(jié)構(gòu)
3.1蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)
3.2蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)
參考文獻(xiàn)
第4章蛋白質(zhì)的超二級(jí)結(jié)構(gòu)Motif
4.1連接多肽
4.2蛋白質(zhì)中的超二級(jí)結(jié)構(gòu)
4.3頻繁發(fā)生的蛋白質(zhì)超二級(jí)結(jié)構(gòu)Motif類(lèi)型
4.4超二級(jí)結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)特征描述
4.5簡(jiǎn)單的超二級(jí)結(jié)構(gòu)Motif折疊組合成復(fù)雜超二級(jí)結(jié)構(gòu)Motif
參考文獻(xiàn)
第5章復(fù)雜超二級(jí)結(jié)構(gòu)Motif與折疊子類(lèi)(Folds)
5.1復(fù)雜超二級(jí)結(jié)構(gòu)Motif折疊組合高級(jí)結(jié)構(gòu)
5.2折疊子類(lèi)
5.3折疊子與結(jié)構(gòu)類(lèi)型
參考文獻(xiàn)
第6章蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)與結(jié)構(gòu)域
6.1蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)
6.2結(jié)構(gòu)域
6.3球狀蛋白質(zhì)和結(jié)構(gòu)域的解剖學(xué)
6.4蛋白質(zhì)(結(jié)構(gòu)域)立體結(jié)構(gòu)的比較
參考文獻(xiàn)
第7章蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)體系
7.1蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)
7.2蛋白質(zhì)體系
參考文獻(xiàn)
第8章蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)分析
8.1晶體結(jié)構(gòu)分析簡(jiǎn)介
8.2蛋白質(zhì)晶體學(xué)簡(jiǎn)介
8.3蛋白質(zhì)晶體生長(zhǎng)
8.4數(shù)據(jù)收集和處理
8.5同晶置換法
8.6分子置換法
8.7同晶差值傅里葉法
8.8電子密度圖的計(jì)算和解釋
8.9結(jié)構(gòu)精修
參考文獻(xiàn)
第9章多維核磁共振技術(shù)
9.1多維核磁共振方法確定蛋白質(zhì)溶液三維結(jié)構(gòu)的基本原理
9.2提取蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息的多維核磁共振方法
9.3蛋白質(zhì)溶液三維結(jié)構(gòu)的計(jì)算
參考文獻(xiàn)
第10章蛋白質(zhì)溶液構(gòu)象的光譜技術(shù)
10.1紫外-可見(jiàn)差光譜
10.2熒光探針?lè)?br />10.3圓二色譜..
10.4激光拉曼光譜
10.5紅外光譜在研究蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第11章蛋白質(zhì)的二維結(jié)晶及結(jié)構(gòu)重建
11.1蛋白質(zhì)晶體的類(lèi)型
11.2蛋白質(zhì)的二維結(jié)晶化
11.3膜蛋白二維晶體形成的機(jī)制與條件
11.4電鏡觀察與三維結(jié)構(gòu)重建
參考文獻(xiàn)
第12章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)圖象分析與分子模擬技術(shù)
12.1計(jì)算機(jī)圖形學(xué)
12.2圖形顯示設(shè)備
12.3圖形系統(tǒng)和工作站
12.4生物大分子的分子模擬與計(jì)算機(jī)圖形技術(shù)
參考文獻(xiàn)
第13章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
13.1蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)概述
13.2正誤構(gòu)象的判斷
13.3現(xiàn)階段幾種主要的簡(jiǎn)單評(píng)估函數(shù)方法
13.4基于知識(shí)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè).
13.5蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
13.6利用計(jì)算機(jī)互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
參考文獻(xiàn)
第14章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中的幾種數(shù)理方法
14.1遺傳算法
14.2人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法
14.3統(tǒng)計(jì)物理學(xué)方法
14.4一些數(shù)理方法算法的進(jìn)一步討論
參考文獻(xiàn)
第15章蛋白質(zhì)分子動(dòng)力學(xué)
15.1分子動(dòng)力學(xué)模擬方法
15.2經(jīng)驗(yàn)力場(chǎng)和位能函數(shù)
15.3能量?jī)?yōu)化
15.4自由能計(jì)算
15.5模擬退火技術(shù)
15.6環(huán)境效應(yīng)
15.7簡(jiǎn)振模分析
參考文獻(xiàn)
第16章蛋白質(zhì)工程與藥物分子設(shè)計(jì)
16.1什么是蛋白質(zhì)工程
16.2蛋白質(zhì)工程領(lǐng)域的開(kāi)創(chuàng)性工作
16.3蛋白質(zhì)的改性及分子設(shè)計(jì)——當(dāng)前蛋白質(zhì)工程研究的熱點(diǎn)之一
16.4基于生物大分子結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)——當(dāng)前蛋白質(zhì)工程
16.5蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與藥物分子設(shè)計(jì)
16.6尚待解決的問(wèn)題和充滿(mǎn)希望的前景
參考文獻(xiàn)
第17章蛋白質(zhì)的分子進(jìn)化
17.1分子進(jìn)化鐘與中性理論
17.2功能相關(guān)的分子進(jìn)化與非中性分子進(jìn)化
參考文獻(xiàn)
第18章酶分子的結(jié)構(gòu)與功能
18.1酶分子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
18.2酶催化作用特點(diǎn)
18.3酶的分類(lèi)和命名法
18.4酶的抑制作用
18.5調(diào)節(jié)酶
18.6羧肽酶A的催化功能和分子結(jié)構(gòu)
18.7多酶復(fù)合物
參考文獻(xiàn)
第19章蛋白質(zhì)的分子運(yùn)動(dòng)
19.1蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)
19.2蛋白質(zhì)分子的運(yùn)動(dòng)
19.3展望.
參考文獻(xiàn)
第20章電子傳遞蛋白的結(jié)構(gòu)與功能
20.1細(xì)胞色素c
20.2鐵硫蛋白
20.3藍(lán)色銅蛋白
20.4黃素氧還蛋白
參考文獻(xiàn)...
附錄用傅里葉變換方法進(jìn)行三維重構(gòu)的一般原理