蛋白質(zhì)工程

第一章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)
　第一節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的基本組件
　　一、20種天然常見氨基酸
　　二、肽單位和多肽鏈
　　三、α螺旋
　　四、β層
　　五、環(huán)肽鏈
　　六、疏水內(nèi)核
　第二節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組織和主要類型
　　一、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的層次體系
　　二、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類
　　三、三類主要蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
　第三節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的形成多肽鏈的生物合成與折疊
　　一、多肽鏈的生物合成
　　二、多肽鏈的折疊蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的形成
　　三、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)工程
　參考文獻
第二章 蛋白質(zhì)分子設(shè)計
　第一節(jié) 基于天然蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分子設(shè)計
　　一、概述
　　二、蛋白質(zhì)設(shè)計原理
　　三、蛋白質(zhì)設(shè)計中的結(jié)構(gòu)功能關(guān)系研究
　　四、天然蛋白質(zhì)的剪裁
　第二節(jié) 全新蛋白質(zhì)設(shè)計
　　一、引言
　　二、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的從頭設(shè)計
　　三、蛋白質(zhì)的功能設(shè)計
　第三節(jié) 計算蛋白質(zhì)設(shè)計
　　一、能量表達
　　二、能量優(yōu)化
　　三、序列優(yōu)化
　　四、序列－結(jié)構(gòu)專一性
　　五、底物專一性設(shè)計
　　六、金屬結(jié)合位點的設(shè)計
　參考文獻
第三章 蛋白質(zhì)的修飾和表達
　第一節(jié) 蛋白質(zhì)修飾的化學(xué)途徑
　　一、功能基團的特異性修飾
　　二、基于蛋白質(zhì)片段的嵌合修飾
　第二節(jié) 蛋白質(zhì)改造的分子生物學(xué)途徑
　　一、編碼基因的專一性位點和區(qū)域性定向突變
　　二、基因融合和基因剪接
　　三、tRNA介導(dǎo)定點攙入非天然氨基酸
　第三節(jié) 重組蛋白質(zhì)的表達
　　一、目標蛋白質(zhì)在大腸桿菌中的表達
　　二、目標蛋白質(zhì)在酵母細胞中的表達
　　三、重組蛋白質(zhì)在哺乳動物細胞中的表達
　　四、噬菌體顯示
　參考文獻
第四章 突變蛋白質(zhì)的物理化學(xué)性質(zhì)分析
　第一節(jié) 蛋白質(zhì)溶液的熱力學(xué)
　　一、熱運動與蛋白質(zhì)構(gòu)象
　　二、熱力學(xué)函數(shù)與熱力學(xué)平衡
　　三、熱容量
　　四、van’t Hoff焓
　　五、折疊/退折疊轉(zhuǎn)變
　　六、量熱法與折疊過程熱力學(xué)
　第二節(jié) 蛋白質(zhì)折疊動理學(xué)
　　一、折疊動理研究技術(shù)
　　二、兩態(tài)動理
　　三、過渡態(tài)
　　四、折疊中間態(tài)
　　五、折疊的基本過程
　第三節(jié) 突變、穩(wěn)定性和折疊
　　一、熱力學(xué)參數(shù)在分子水平上的解釋
　　二、突變與熱穩(wěn)定性
　　三、突變與折疊過程
　參考文獻
第五章 天然和重組蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定
　第一節(jié) X射線晶體結(jié)構(gòu)分析
　　一、概念基本原理
　　二、蛋白質(zhì)結(jié)晶和晶體生長
　　三、衍射數(shù)據(jù)收集
　　四、確定位相
　　五、電子密度圖詮釋
　　六、結(jié)構(gòu)模型精化
　參考文獻
　第二節(jié) 核磁共振波譜的溶液結(jié)構(gòu)解析
　　一、概述蛋白質(zhì)溶液三級結(jié)構(gòu)測定
　　二、基本的多維核磁共振實驗
　　三、多維核磁共振波譜解析簡介
　參考文獻
　第三節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
　　一、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法準確性的評估
　　二、序列相似性對比
　　三、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
　　四、蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
　　五、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測與藥物設(shè)計
　　六、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫
　參考文獻
第六章 蛋白質(zhì)工程在醫(yī)藥工業(yè)中的應(yīng)用
　第一節(jié) 醫(yī)用抗體的蛋白質(zhì)工程
　　一、抗體的產(chǎn)生和抗體的結(jié)構(gòu)簡介
　　二、從抗血清到重組抗體
　　三、抗體工程
　第二節(jié) 組織纖維蛋白溶酶原激活因子的蛋白質(zhì)工程
　　一、有關(guān)重組t－PA
　　二、產(chǎn)生t－PA突變體的基本原理
　　三、t－PA蛋白質(zhì)工程的幾個方面
　第三節(jié) 基于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的小分子藥物設(shè)計
　　一、用DOCK發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物252
　　二、Haloperidol衍生物對HIV－1 PR的抑制
中西文名詞對照